Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCSHP23434 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCSHP23434 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCSHP23434 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCSHP23434 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCSHP23434 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCSHP23434 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCSHP23434 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCSHP23434 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCSHP23434 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCSHP23434 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCSHP23434 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCSHP23434 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GCSHP23434 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCSHP23434 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCSHP23434 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCSHP23434 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCSHP23434 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GCSHP23434 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCSHP23434 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GCSHP23434 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCSHP23434 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCSHP23434 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GCSHP23434 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCSHP23434 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCSHP23434 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCSHP23434 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCSHP23434 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCSHP23434 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GCSHP23434 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCSHP23434 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GCSHP23434 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCSHP23434 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GCSHP23434 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GCSHP23434 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCSHP23434 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCSHP23434 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCSHP23434 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCSHP23434 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCSHP23434 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCSHP23434 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCSHP23434 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCSHP23434 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCSHP23434 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCSHP23434 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCSHP23434 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCSHP23434 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCSHP23434 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCSHP23434 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCSHP23434 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCSHP23434 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCSHP23434 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCSHP23434 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCSHP23434 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCSHP23434 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCSHP23434 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCSHP23434 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCSHP23434 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCSHP23434 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCSHP23434 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCSHP23434 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSHP23434 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSHP23434 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSHP23434 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSHP23434 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GCSHP23434 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSHP23434 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSHP23434 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSHP23434 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSHP23434 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSHP23434 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSHP23434 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSHP23434 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GCSHP23434 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSHP23434 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSHP23434 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSHP23434 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSHP23434 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GCSHP23434 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSHP23434 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSHP23434 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSHP23434 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSHP23434 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSHP23434 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSHP23434 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSHP23434 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSHP23434 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSHP23434 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GCSHP23434 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCSHP23434 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GCSHP23434 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GCSHP23434 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCSHP23434 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCSHP23434 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCSHP23434 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCSHP23434 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCSHP23434 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCSHP23434 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GCSHP23434 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GCSHP23434 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms