Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NR4A1P22736 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR4A1P22736 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR4A1P22736 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR4A1P22736 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR4A1P22736 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR4A1P22736 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR4A1P22736 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR4A1P22736 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR4A1P22736 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR4A1P22736 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR4A1P22736 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR4A1P22736 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR4A1P22736 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR4A1P22736 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR4A1P22736 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR4A1P22736 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR4A1P22736 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR4A1P22736 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR4A1P22736 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR4A1P22736 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NR4A1P22736 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR4A1P22736 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR4A1P22736 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR4A1P22736 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR4A1P22736 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR4A1P22736 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR4A1P22736 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR4A1P22736 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR4A1P22736 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR4A1P22736 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR4A1P22736 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NR4A1P22736 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR4A1P22736 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NR4A1P22736 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR4A1P22736 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR4A1P22736 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR4A1P22736 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR4A1P22736 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NR4A1P22736 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NR4A1P22736 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NR4A1P22736 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR4A1P22736 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR4A1P22736 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR4A1P22736 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR4A1P22736 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NR4A1P22736 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR4A1P22736 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR4A1P22736 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR4A1P22736 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR4A1P22736 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR4A1P22736 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR4A1P22736 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR4A1P22736 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR4A1P22736 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR4A1P22736 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR4A1P22736 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR4A1P22736 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR4A1P22736 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR4A1P22736 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR4A1P22736 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR4A1P22736 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR4A1P22736 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR4A1P22736 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms