Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC2P18074 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC2P18074 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC2P18074 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC2P18074 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC2P18074 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC2P18074 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC2P18074 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC2P18074 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC2P18074 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ERCC2P18074 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC2P18074 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC2P18074 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC2P18074 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC2P18074 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERCC2P18074 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC2P18074 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ERCC2P18074 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERCC2P18074 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC2P18074 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERCC2P18074 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC2P18074 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERCC2P18074 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC2P18074 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC2P18074 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERCC2P18074 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC2P18074 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC2P18074 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERCC2P18074 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC2P18074 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERCC2P18074 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERCC2P18074 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC2P18074 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC2P18074 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC2P18074 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC2P18074 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC2P18074 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC2P18074 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC2P18074 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC2P18074 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC2P18074 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC2P18074 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ERCC2P18074 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC2P18074 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC2P18074 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC2P18074 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC2P18074 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC2P18074 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC2P18074 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC2P18074 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC2P18074 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC2P18074 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC2P18074 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC2P18074 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms