Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DESP17661 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DESP17661 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DESP17661 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DESP17661 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DESP17661 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DESP17661 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DESP17661 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DESP17661 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DESP17661 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DESP17661 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DESP17661 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DESP17661 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DESP17661 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DESP17661 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DESP17661 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DESP17661 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DESP17661 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DESP17661 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DESP17661 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DESP17661 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
DESP17661 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DESP17661 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DESP17661 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DESP17661 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DESP17661 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DESP17661 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DESP17661 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DESP17661 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DESP17661 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DESP17661 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DESP17661 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DESP17661 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DESP17661 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DESP17661 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DESP17661 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DESP17661 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DESP17661 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DESP17661 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DESP17661 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DESP17661 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DESP17661 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DESP17661 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DESP17661 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DESP17661 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DESP17661 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DESP17661 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DESP17661 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DESP17661 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DESP17661 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DESP17661 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DESP17661 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DESP17661 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DESP17661 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DESP17661 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DESP17661 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DESP17661 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DESP17661 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DESP17661 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DESP17661 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DESP17661 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DESP17661 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DESP17661 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DESP17661 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DESP17661 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DESP17661 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DESP17661 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DESP17661 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DESP17661 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DESP17661 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DESP17661 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DESP17661 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DESP17661 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DESP17661 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DESP17661 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DESP17661 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DESP17661 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DESP17661 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DESP17661 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DESP17661 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DESP17661 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DESP17661 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DESP17661 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DESP17661 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DESP17661 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DESP17661 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DESP17661 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DESP17661 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DESP17661 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DESP17661 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DESP17661 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DESP17661 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DESP17661 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DESP17661 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DESP17661 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DESP17661 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DESP17661 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DESP17661 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DESP17661 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DESP17661 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms