Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DSPP15924 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSPP15924 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DSPP15924 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DSPP15924 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DSPP15924 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DSPP15924 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSPP15924 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSPP15924 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSPP15924 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DSPP15924 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSPP15924 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DSPP15924 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DSPP15924 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DSPP15924 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DSPP15924 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSPP15924 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSPP15924 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSPP15924 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSPP15924 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSPP15924 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSPP15924 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
DSPP15924 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DSPP15924 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DSPP15924 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DSPP15924 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSPP15924 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSPP15924 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSPP15924 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSPP15924 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSPP15924 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DSPP15924 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSPP15924 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSPP15924 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSPP15924 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSPP15924 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSPP15924 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSPP15924 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSPP15924 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DSPP15924 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSPP15924 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DSPP15924 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSPP15924 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSPP15924 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSPP15924 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSPP15924 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSPP15924 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSPP15924 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSPP15924 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSPP15924 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSPP15924 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSPP15924 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSPP15924 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DSPP15924 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSPP15924 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSPP15924 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSPP15924 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSPP15924 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSPP15924 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSPP15924 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSPP15924 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSPP15924 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSPP15924 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DSPP15924 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSPP15924 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSPP15924 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSPP15924 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSPP15924 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DSPP15924 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DSPP15924 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSPP15924 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSPP15924 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DSPP15924 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSPP15924 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DSPP15924 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DSPP15924 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DSPP15924 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DSPP15924 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DSPP15924 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DSPP15924 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSPP15924 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSPP15924 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DSPP15924 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSPP15924 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSPP15924 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSPP15924 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSPP15924 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSPP15924 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSPP15924 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSPP15924 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSPP15924 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSPP15924 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DSPP15924 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DSPP15924 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DSPP15924 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSPP15924 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSPP15924 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSPP15924 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSPP15924 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DSPP15924 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms