Protein–RNA interactions for Protein: P15882

CHN1, N-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN1P15882 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHN1P15882 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHN1P15882 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHN1P15882 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHN1P15882 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHN1P15882 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHN1P15882 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHN1P15882 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHN1P15882 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHN1P15882 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHN1P15882 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHN1P15882 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHN1P15882 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHN1P15882 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHN1P15882 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHN1P15882 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHN1P15882 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHN1P15882 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHN1P15882 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHN1P15882 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHN1P15882 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHN1P15882 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHN1P15882 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHN1P15882 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHN1P15882 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHN1P15882 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHN1P15882 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHN1P15882 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHN1P15882 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHN1P15882 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHN1P15882 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHN1P15882 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHN1P15882 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHN1P15882 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHN1P15882 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHN1P15882 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHN1P15882 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHN1P15882 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHN1P15882 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHN1P15882 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHN1P15882 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHN1P15882 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHN1P15882 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHN1P15882 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHN1P15882 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHN1P15882 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHN1P15882 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHN1P15882 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHN1P15882 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHN1P15882 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHN1P15882 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
CHN1P15882 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHN1P15882 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHN1P15882 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHN1P15882 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHN1P15882 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHN1P15882 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHN1P15882 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHN1P15882 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHN1P15882 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHN1P15882 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHN1P15882 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHN1P15882 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHN1P15882 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHN1P15882 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHN1P15882 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHN1P15882 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHN1P15882 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHN1P15882 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHN1P15882 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHN1P15882 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHN1P15882 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHN1P15882 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHN1P15882 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHN1P15882 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHN1P15882 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHN1P15882 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHN1P15882 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHN1P15882 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHN1P15882 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHN1P15882 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHN1P15882 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CHN1P15882 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHN1P15882 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHN1P15882 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHN1P15882 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHN1P15882 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHN1P15882 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHN1P15882 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHN1P15882 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHN1P15882 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHN1P15882 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHN1P15882 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHN1P15882 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHN1P15882 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHN1P15882 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHN1P15882 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHN1P15882 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHN1P15882 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHN1P15882 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms