Protein–RNA interactions for Protein: P15882

CHN1, N-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN1P15882 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHN1P15882 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CHN1P15882 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CHN1P15882 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHN1P15882 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHN1P15882 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CHN1P15882 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHN1P15882 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CHN1P15882 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CHN1P15882 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
CHN1P15882 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CHN1P15882 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHN1P15882 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CHN1P15882 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHN1P15882 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHN1P15882 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHN1P15882 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHN1P15882 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CHN1P15882 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHN1P15882 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CHN1P15882 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHN1P15882 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHN1P15882 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CHN1P15882 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHN1P15882 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHN1P15882 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHN1P15882 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHN1P15882 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CHN1P15882 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHN1P15882 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CHN1P15882 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CHN1P15882 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CHN1P15882 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CHN1P15882 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHN1P15882 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHN1P15882 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHN1P15882 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHN1P15882 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHN1P15882 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHN1P15882 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHN1P15882 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHN1P15882 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHN1P15882 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHN1P15882 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHN1P15882 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHN1P15882 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CHN1P15882 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CHN1P15882 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHN1P15882 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHN1P15882 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHN1P15882 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHN1P15882 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHN1P15882 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHN1P15882 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHN1P15882 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHN1P15882 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHN1P15882 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHN1P15882 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CHN1P15882 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHN1P15882 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHN1P15882 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHN1P15882 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHN1P15882 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHN1P15882 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHN1P15882 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHN1P15882 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CHN1P15882 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHN1P15882 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHN1P15882 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHN1P15882 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHN1P15882 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHN1P15882 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHN1P15882 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHN1P15882 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHN1P15882 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHN1P15882 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHN1P15882 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHN1P15882 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHN1P15882 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHN1P15882 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHN1P15882 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHN1P15882 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHN1P15882 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHN1P15882 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHN1P15882 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHN1P15882 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHN1P15882 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHN1P15882 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHN1P15882 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHN1P15882 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHN1P15882 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHN1P15882 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHN1P15882 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHN1P15882 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHN1P15882 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHN1P15882 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHN1P15882 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHN1P15882 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHN1P15882 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHN1P15882 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms