Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SRFP11831 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRFP11831 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRFP11831 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SRFP11831 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRFP11831 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SRFP11831 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRFP11831 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRFP11831 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRFP11831 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRFP11831 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRFP11831 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRFP11831 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRFP11831 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SRFP11831 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRFP11831 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRFP11831 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRFP11831 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRFP11831 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRFP11831 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRFP11831 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRFP11831 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRFP11831 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SRFP11831 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRFP11831 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SRFP11831 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRFP11831 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRFP11831 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SRFP11831 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRFP11831 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRFP11831 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRFP11831 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRFP11831 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRFP11831 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRFP11831 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRFP11831 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRFP11831 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRFP11831 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRFP11831 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRFP11831 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRFP11831 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRFP11831 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRFP11831 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRFP11831 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRFP11831 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRFP11831 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRFP11831 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SRFP11831 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRFP11831 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRFP11831 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRFP11831 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRFP11831 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRFP11831 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRFP11831 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SRFP11831 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRFP11831 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRFP11831 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRFP11831 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRFP11831 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRFP11831 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRFP11831 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRFP11831 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRFP11831 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRFP11831 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRFP11831 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRFP11831 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRFP11831 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRFP11831 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRFP11831 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRFP11831 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRFP11831 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRFP11831 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRFP11831 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SRFP11831 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRFP11831 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRFP11831 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SRFP11831 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRFP11831 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRFP11831 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRFP11831 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRFP11831 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRFP11831 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRFP11831 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRFP11831 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRFP11831 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRFP11831 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRFP11831 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRFP11831 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRFP11831 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRFP11831 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRFP11831 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRFP11831 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRFP11831 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRFP11831 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SRFP11831 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRFP11831 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRFP11831 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRFP11831 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRFP11831 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRFP11831 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms