Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC159P0C7I6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC159P0C7I6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC159P0C7I6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC159P0C7I6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC159P0C7I6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC159P0C7I6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC159P0C7I6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC159P0C7I6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC159P0C7I6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC159P0C7I6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC159P0C7I6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC159P0C7I6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC159P0C7I6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC159P0C7I6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC159P0C7I6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC159P0C7I6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC159P0C7I6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC159P0C7I6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC159P0C7I6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC159P0C7I6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC159P0C7I6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC159P0C7I6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC159P0C7I6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC159P0C7I6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC159P0C7I6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms