Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB3P05106 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB3P05106 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGB3P05106 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGB3P05106 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGB3P05106 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ITGB3P05106 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGB3P05106 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB3P05106 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITGB3P05106 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB3P05106 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB3P05106 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITGB3P05106 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB3P05106 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB3P05106 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB3P05106 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITGB3P05106 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB3P05106 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB3P05106 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITGB3P05106 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGB3P05106 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGB3P05106 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITGB3P05106 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITGB3P05106 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB3P05106 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITGB3P05106 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITGB3P05106 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB3P05106 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB3P05106 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB3P05106 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB3P05106 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB3P05106 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB3P05106 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB3P05106 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB3P05106 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB3P05106 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB3P05106 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB3P05106 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB3P05106 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB3P05106 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB3P05106 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB3P05106 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB3P05106 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB3P05106 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB3P05106 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB3P05106 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB3P05106 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB3P05106 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB3P05106 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB3P05106 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB3P05106 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB3P05106 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB3P05106 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGB3P05106 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB3P05106 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB3P05106 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB3P05106 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB3P05106 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB3P05106 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB3P05106 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB3P05106 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB3P05106 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB3P05106 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB3P05106 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB3P05106 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB3P05106 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB3P05106 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB3P05106 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB3P05106 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB3P05106 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB3P05106 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB3P05106 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB3P05106 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB3P05106 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB3P05106 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB3P05106 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB3P05106 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms