Protein–RNA interactions for Protein: P04629

NTRK1, High affinity nerve growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK1P04629 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NTRK1P04629 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NTRK1P04629 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NTRK1P04629 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NTRK1P04629 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NTRK1P04629 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NTRK1P04629 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NTRK1P04629 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTRK1P04629 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTRK1P04629 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NTRK1P04629 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NTRK1P04629 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTRK1P04629 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTRK1P04629 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTRK1P04629 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTRK1P04629 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTRK1P04629 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTRK1P04629 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NTRK1P04629 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NTRK1P04629 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NTRK1P04629 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NTRK1P04629 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NTRK1P04629 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NTRK1P04629 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTRK1P04629 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTRK1P04629 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTRK1P04629 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTRK1P04629 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK1P04629 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK1P04629 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTRK1P04629 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK1P04629 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK1P04629 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTRK1P04629 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NTRK1P04629 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NTRK1P04629 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NTRK1P04629 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NTRK1P04629 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTRK1P04629 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTRK1P04629 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTRK1P04629 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTRK1P04629 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTRK1P04629 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTRK1P04629 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTRK1P04629 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NTRK1P04629 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NTRK1P04629 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NTRK1P04629 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NTRK1P04629 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NTRK1P04629 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NTRK1P04629 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NTRK1P04629 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NTRK1P04629 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NTRK1P04629 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NTRK1P04629 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NTRK1P04629 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NTRK1P04629 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NTRK1P04629 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTRK1P04629 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NTRK1P04629 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NTRK1P04629 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NTRK1P04629 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NTRK1P04629 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK1P04629 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK1P04629 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK1P04629 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK1P04629 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTRK1P04629 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTRK1P04629 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTRK1P04629 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTRK1P04629 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTRK1P04629 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NTRK1P04629 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NTRK1P04629 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NTRK1P04629 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NTRK1P04629 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms