Protein–RNA interactions for Protein: O75971

SNAPC5, snRNA-activating protein complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC5O75971 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAPC5O75971 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNAPC5O75971 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAPC5O75971 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAPC5O75971 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNAPC5O75971 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAPC5O75971 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNAPC5O75971 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAPC5O75971 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAPC5O75971 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNAPC5O75971 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAPC5O75971 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNAPC5O75971 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAPC5O75971 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAPC5O75971 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNAPC5O75971 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNAPC5O75971 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNAPC5O75971 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNAPC5O75971 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNAPC5O75971 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNAPC5O75971 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC5O75971 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC5O75971 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC5O75971 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC5O75971 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNAPC5O75971 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAPC5O75971 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAPC5O75971 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAPC5O75971 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAPC5O75971 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNAPC5O75971 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNAPC5O75971 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNAPC5O75971 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNAPC5O75971 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAPC5O75971 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAPC5O75971 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAPC5O75971 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAPC5O75971 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNAPC5O75971 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC5O75971 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC5O75971 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC5O75971 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC5O75971 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNAPC5O75971 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC5O75971 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC5O75971 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC5O75971 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC5O75971 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNAPC5O75971 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAPC5O75971 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAPC5O75971 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAPC5O75971 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNAPC5O75971 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms