Protein–RNA interactions for Protein: O75325

LRRN2, Leucine-rich repeat neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN2O75325 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRN2O75325 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRN2O75325 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRN2O75325 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRN2O75325 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRN2O75325 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRN2O75325 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRN2O75325 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRN2O75325 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRN2O75325 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRN2O75325 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRN2O75325 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRN2O75325 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRN2O75325 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRN2O75325 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRN2O75325 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRN2O75325 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRN2O75325 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRN2O75325 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRN2O75325 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRN2O75325 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRN2O75325 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRN2O75325 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
LRRN2O75325 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRN2O75325 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRN2O75325 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRN2O75325 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRN2O75325 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRN2O75325 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRN2O75325 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRN2O75325 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRN2O75325 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRN2O75325 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRN2O75325 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRN2O75325 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRN2O75325 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRN2O75325 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRN2O75325 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRN2O75325 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRN2O75325 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRN2O75325 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRN2O75325 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRN2O75325 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRN2O75325 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRN2O75325 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRN2O75325 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRN2O75325 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRN2O75325 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRN2O75325 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRN2O75325 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRN2O75325 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRN2O75325 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRN2O75325 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRN2O75325 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRN2O75325 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRN2O75325 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms