Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC53.69■■■■■ 6.18
ABCC9O60706 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.68■■■■■ 6.18
ABCC9O60706 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC53.67■■■■■ 6.18
ABCC9O60706 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC53.66■■■■■ 6.18
ABCC9O60706 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC53.66■■■■■ 6.18
ABCC9O60706 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC53.65■■■■■ 6.18
ABCC9O60706 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.64■■■■■ 6.18
ABCC9O60706 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC53.63■■■■■ 6.18
ABCC9O60706 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC53.61■■■■■ 6.17
ABCC9O60706 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC53.61■■■■■ 6.17
ABCC9O60706 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.6■■■■■ 6.17
ABCC9O60706 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC53.59■■■■■ 6.17
ABCC9O60706 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC53.58■■■■■ 6.17
ABCC9O60706 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.55■■■■■ 6.16
ABCC9O60706 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC53.55■■■■■ 6.16
ABCC9O60706 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.53■■■■■ 6.16
ABCC9O60706 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC53.53■■■■■ 6.16
ABCC9O60706 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC53.52■■■■■ 6.16
ABCC9O60706 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.52■■■■■ 6.16
ABCC9O60706 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.51■■■■■ 6.16
ABCC9O60706 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC53.5■■■■■ 6.16
ABCC9O60706 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC53.5■■■■■ 6.15
ABCC9O60706 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC53.5■■■■■ 6.15
ABCC9O60706 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC53.5■■■■■ 6.15
ABCC9O60706 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.48■■■■■ 6.15
ABCC9O60706 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC53.44■■■■■ 6.15
ABCC9O60706 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.44■■■■■ 6.15
ABCC9O60706 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC53.43■■■■■ 6.14
ABCC9O60706 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.43■■■■■ 6.14
ABCC9O60706 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.41■■■■■ 6.14
ABCC9O60706 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC53.41■■■■■ 6.14
ABCC9O60706 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC53.39■■■■■ 6.14
ABCC9O60706 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC53.38■■■■■ 6.14
ABCC9O60706 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC53.38■■■■■ 6.14
ABCC9O60706 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.37■■■■■ 6.13
ABCC9O60706 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC53.37■■■■■ 6.13
ABCC9O60706 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC53.36■■■■■ 6.13
ABCC9O60706 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC53.35■■■■■ 6.13
ABCC9O60706 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC53.35■■■■■ 6.13
ABCC9O60706 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC53.35■■■■■ 6.13
ABCC9O60706 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.33■■■■■ 6.13
ABCC9O60706 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC53.32■■■■■ 6.13
ABCC9O60706 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.32■■■■■ 6.13
ABCC9O60706 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC53.31■■■■■ 6.12
ABCC9O60706 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC53.31■■■■■ 6.12
ABCC9O60706 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.29■■■■■ 6.12
ABCC9O60706 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.28■■■■■ 6.12
ABCC9O60706 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.28■■■■■ 6.12
ABCC9O60706 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.28■■■■■ 6.12
ABCC9O60706 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC53.26■■■■■ 6.12
ABCC9O60706 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC53.25■■■■■ 6.12
ABCC9O60706 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC53.25■■■■■ 6.11
ABCC9O60706 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.23■■■■■ 6.11
ABCC9O60706 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC53.23■■■■■ 6.11
ABCC9O60706 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.22■■■■■ 6.11
ABCC9O60706 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC53.22■■■■■ 6.11
ABCC9O60706 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.21■■■■■ 6.11
ABCC9O60706 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC53.21■■■■■ 6.11
ABCC9O60706 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC53.2■■■■■ 6.11
ABCC9O60706 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC53.2■■■■■ 6.11
ABCC9O60706 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.2■■■■■ 6.11
ABCC9O60706 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC53.2■■■■■ 6.11
ABCC9O60706 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC53.19■■■■■ 6.11
ABCC9O60706 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.18■■■■■ 6.1
ABCC9O60706 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC53.18■■■■■ 6.1
ABCC9O60706 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC53.18■■■■■ 6.1
ABCC9O60706 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC53.18■■■■■ 6.1
ABCC9O60706 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC53.17■■■■■ 6.1
ABCC9O60706 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC53.17■■■■■ 6.1
ABCC9O60706 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC53.15■■■■■ 6.1
ABCC9O60706 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.15■■■■■ 6.1
ABCC9O60706 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC53.14■■■■■ 6.1
ABCC9O60706 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC53.14■■■■■ 6.1
ABCC9O60706 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC53.13■■■■■ 6.1
ABCC9O60706 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.12■■■■■ 6.09
ABCC9O60706 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.09■■■■■ 6.09
ABCC9O60706 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC53.09■■■■■ 6.09
ABCC9O60706 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.09■■■■■ 6.09
ABCC9O60706 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC53.08■■■■■ 6.09
ABCC9O60706 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC53.08■■■■■ 6.09
ABCC9O60706 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC53.08■■■■■ 6.09
ABCC9O60706 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.07■■■■■ 6.09
ABCC9O60706 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC53.06■■■■■ 6.08
ABCC9O60706 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC53.05■■■■■ 6.08
ABCC9O60706 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.05■■■■■ 6.08
ABCC9O60706 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.03■■■■■ 6.08
ABCC9O60706 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC53.03■■■■■ 6.08
ABCC9O60706 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC53.02■■■■■ 6.08
ABCC9O60706 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC53.01■■■■■ 6.08
ABCC9O60706 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.99■■■■■ 6.07
ABCC9O60706 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC52.99■■■■■ 6.07
ABCC9O60706 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC52.99■■■■■ 6.07
ABCC9O60706 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.96■■■■■ 6.07
ABCC9O60706 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC52.96■■■■■ 6.07
ABCC9O60706 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC52.96■■■■■ 6.07
ABCC9O60706 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC52.96■■■■■ 6.07
ABCC9O60706 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52.95■■■■■ 6.07
ABCC9O60706 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.95■■■■■ 6.07
ABCC9O60706 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.95■■■■■ 6.07
ABCC9O60706 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.94■■■■■ 6.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms