Protein–RNA interactions for Protein: O60671

RAD1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD1O60671 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD1O60671 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD1O60671 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD1O60671 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD1O60671 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAD1O60671 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD1O60671 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD1O60671 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD1O60671 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD1O60671 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD1O60671 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD1O60671 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD1O60671 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD1O60671 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD1O60671 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD1O60671 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD1O60671 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD1O60671 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD1O60671 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD1O60671 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD1O60671 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD1O60671 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD1O60671 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD1O60671 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD1O60671 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD1O60671 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD1O60671 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD1O60671 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD1O60671 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD1O60671 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD1O60671 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD1O60671 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD1O60671 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD1O60671 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD1O60671 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD1O60671 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAD1O60671 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAD1O60671 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAD1O60671 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD1O60671 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD1O60671 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD1O60671 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD1O60671 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD1O60671 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD1O60671 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD1O60671 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD1O60671 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD1O60671 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD1O60671 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD1O60671 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD1O60671 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD1O60671 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD1O60671 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD1O60671 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD1O60671 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD1O60671 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD1O60671 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAD1O60671 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD1O60671 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD1O60671 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD1O60671 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD1O60671 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD1O60671 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD1O60671 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD1O60671 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD1O60671 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD1O60671 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD1O60671 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD1O60671 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD1O60671 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD1O60671 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD1O60671 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD1O60671 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD1O60671 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD1O60671 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD1O60671 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD1O60671 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD1O60671 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD1O60671 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD1O60671 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD1O60671 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD1O60671 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD1O60671 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD1O60671 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD1O60671 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD1O60671 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD1O60671 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD1O60671 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD1O60671 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD1O60671 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD1O60671 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD1O60671 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD1O60671 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD1O60671 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD1O60671 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD1O60671 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD1O60671 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD1O60671 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD1O60671 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD1O60671 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms