Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD5O60279 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUSD5O60279 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUSD5O60279 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SUSD5O60279 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUSD5O60279 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUSD5O60279 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SUSD5O60279 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SUSD5O60279 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD5O60279 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SUSD5O60279 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD5O60279 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD5O60279 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD5O60279 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD5O60279 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SUSD5O60279 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SUSD5O60279 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD5O60279 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD5O60279 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms