Protein–RNA interactions for Protein: O60234

GMFG, Glia maturation factor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFGO60234 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GMFGO60234 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GMFGO60234 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GMFGO60234 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GMFGO60234 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GMFGO60234 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GMFGO60234 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GMFGO60234 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GMFGO60234 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GMFGO60234 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GMFGO60234 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GMFGO60234 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GMFGO60234 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GMFGO60234 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GMFGO60234 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GMFGO60234 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GMFGO60234 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GMFGO60234 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GMFGO60234 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GMFGO60234 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GMFGO60234 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GMFGO60234 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GMFGO60234 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GMFGO60234 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GMFGO60234 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GMFGO60234 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GMFGO60234 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GMFGO60234 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GMFGO60234 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMFGO60234 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMFGO60234 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMFGO60234 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GMFGO60234 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMFGO60234 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMFGO60234 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GMFGO60234 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GMFGO60234 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMFGO60234 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMFGO60234 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GMFGO60234 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GMFGO60234 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GMFGO60234 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMFGO60234 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GMFGO60234 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMFGO60234 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GMFGO60234 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMFGO60234 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMFGO60234 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMFGO60234 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMFGO60234 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMFGO60234 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMFGO60234 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GMFGO60234 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GMFGO60234 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GMFGO60234 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMFGO60234 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GMFGO60234 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMFGO60234 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMFGO60234 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMFGO60234 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMFGO60234 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMFGO60234 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMFGO60234 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GMFGO60234 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GMFGO60234 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GMFGO60234 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GMFGO60234 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GMFGO60234 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GMFGO60234 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GMFGO60234 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GMFGO60234 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GMFGO60234 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GMFGO60234 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GMFGO60234 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GMFGO60234 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GMFGO60234 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMFGO60234 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMFGO60234 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMFGO60234 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMFGO60234 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMFGO60234 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GMFGO60234 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GMFGO60234 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GMFGO60234 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GMFGO60234 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMFGO60234 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMFGO60234 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMFGO60234 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GMFGO60234 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMFGO60234 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMFGO60234 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GMFGO60234 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GMFGO60234 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GMFGO60234 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GMFGO60234 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GMFGO60234 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GMFGO60234 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GMFGO60234 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GMFGO60234 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GMFGO60234 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms