Protein–RNA interactions for Protein: O60229

KALRN, Kalirin, humanhuman

Predictions only

Length 2,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KALRNO60229 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KALRNO60229 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KALRNO60229 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KALRNO60229 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KALRNO60229 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KALRNO60229 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KALRNO60229 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KALRNO60229 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KALRNO60229 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KALRNO60229 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KALRNO60229 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KALRNO60229 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KALRNO60229 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KALRNO60229 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KALRNO60229 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KALRNO60229 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KALRNO60229 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KALRNO60229 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KALRNO60229 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KALRNO60229 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KALRNO60229 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KALRNO60229 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KALRNO60229 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KALRNO60229 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KALRNO60229 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KALRNO60229 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KALRNO60229 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KALRNO60229 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KALRNO60229 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KALRNO60229 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KALRNO60229 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KALRNO60229 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KALRNO60229 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KALRNO60229 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KALRNO60229 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KALRNO60229 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KALRNO60229 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KALRNO60229 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KALRNO60229 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KALRNO60229 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KALRNO60229 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KALRNO60229 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KALRNO60229 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KALRNO60229 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KALRNO60229 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KALRNO60229 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KALRNO60229 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KALRNO60229 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KALRNO60229 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KALRNO60229 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KALRNO60229 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KALRNO60229 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KALRNO60229 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KALRNO60229 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KALRNO60229 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KALRNO60229 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KALRNO60229 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KALRNO60229 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KALRNO60229 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KALRNO60229 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KALRNO60229 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KALRNO60229 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KALRNO60229 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KALRNO60229 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KALRNO60229 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KALRNO60229 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KALRNO60229 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KALRNO60229 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KALRNO60229 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KALRNO60229 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KALRNO60229 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KALRNO60229 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KALRNO60229 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KALRNO60229 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KALRNO60229 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KALRNO60229 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KALRNO60229 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KALRNO60229 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KALRNO60229 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KALRNO60229 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KALRNO60229 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KALRNO60229 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KALRNO60229 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KALRNO60229 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KALRNO60229 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KALRNO60229 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KALRNO60229 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KALRNO60229 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KALRNO60229 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KALRNO60229 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KALRNO60229 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KALRNO60229 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KALRNO60229 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KALRNO60229 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KALRNO60229 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KALRNO60229 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KALRNO60229 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KALRNO60229 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KALRNO60229 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KALRNO60229 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms