Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CYTH3O43739 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CYTH3O43739 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CYTH3O43739 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CYTH3O43739 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CYTH3O43739 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CYTH3O43739 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CYTH3O43739 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CYTH3O43739 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CYTH3O43739 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CYTH3O43739 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CYTH3O43739 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CYTH3O43739 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CYTH3O43739 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CYTH3O43739 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CYTH3O43739 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CYTH3O43739 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CYTH3O43739 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CYTH3O43739 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CYTH3O43739 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CYTH3O43739 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CYTH3O43739 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CYTH3O43739 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CYTH3O43739 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CYTH3O43739 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CYTH3O43739 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CYTH3O43739 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CYTH3O43739 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CYTH3O43739 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CYTH3O43739 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CYTH3O43739 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CYTH3O43739 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CYTH3O43739 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CYTH3O43739 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CYTH3O43739 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CYTH3O43739 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CYTH3O43739 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CYTH3O43739 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CYTH3O43739 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CYTH3O43739 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CYTH3O43739 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CYTH3O43739 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CYTH3O43739 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CYTH3O43739 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CYTH3O43739 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CYTH3O43739 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CYTH3O43739 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CYTH3O43739 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CYTH3O43739 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CYTH3O43739 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CYTH3O43739 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CYTH3O43739 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CYTH3O43739 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CYTH3O43739 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CYTH3O43739 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CYTH3O43739 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CYTH3O43739 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CYTH3O43739 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CYTH3O43739 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CYTH3O43739 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CYTH3O43739 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CYTH3O43739 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CYTH3O43739 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CYTH3O43739 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CYTH3O43739 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CYTH3O43739 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CYTH3O43739 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CYTH3O43739 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CYTH3O43739 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CYTH3O43739 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CYTH3O43739 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CYTH3O43739 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CYTH3O43739 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CYTH3O43739 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CYTH3O43739 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CYTH3O43739 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CYTH3O43739 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CYTH3O43739 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms