Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLXNB1O43157 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PLXNB1O43157 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PLXNB1O43157 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PLXNB1O43157 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PLXNB1O43157 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms