Protein–RNA interactions for Protein: O14493

CLDN4, Claudin-4, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4O14493 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN4O14493 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN4O14493 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN4O14493 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN4O14493 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN4O14493 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN4O14493 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN4O14493 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN4O14493 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN4O14493 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN4O14493 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN4O14493 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN4O14493 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN4O14493 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN4O14493 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN4O14493 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN4O14493 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN4O14493 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN4O14493 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN4O14493 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN4O14493 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN4O14493 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN4O14493 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN4O14493 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN4O14493 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN4O14493 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN4O14493 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN4O14493 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms