Protein–RNA interactions for Protein: J3QR06

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR06 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
J3QR06 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.28■■□□□ 1
J3QR06 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.28■■□□□ 1
J3QR06 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
J3QR06 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
J3QR06 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
J3QR06 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
J3QR06 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
J3QR06 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QR06 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QR06 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QR06 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QR06 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QR06 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QR06 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QR06 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QR06 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QR06 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QR06 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QR06 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QR06 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QR06 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QR06 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QR06 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QR06 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QR06 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QR06 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QR06 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QR06 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QR06 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
J3QR06 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QR06 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QR06 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
J3QR06 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QR06 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QR06 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QR06 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
J3QR06 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QR06 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QR06 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
J3QR06 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QR06 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QR06 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
J3QR06 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QR06 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QR06 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QR06 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
J3QR06 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QR06 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QR06 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QR06 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QR06 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
J3QR06 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QR06 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QR06 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
J3QR06 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QR06 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QR06 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QR06 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
J3QR06 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3QR06 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3QR06 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3QR06 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
J3QR06 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
J3QR06 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QR06 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QR06 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
J3QR06 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QR06 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QR06 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QR06 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
J3QR06 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QR06 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QR06 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QR06 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
J3QR06 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
J3QR06 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
J3QR06 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3QR06 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3QR06 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
J3QR06 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3QR06 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3QR06 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
J3QR06 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
J3QR06 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
J3QR06 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
J3QR06 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
J3QR06 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
J3QR06 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
J3QR06 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
J3QR06 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
J3QR06 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
J3QR06 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
J3QR06 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
J3QR06 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21■□□□□ 0.95
J3QR06 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
J3QR06 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
J3QR06 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
J3QR06 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
J3QR06 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms