Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KT08 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
J3KT08 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KT08 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KT08 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KT08 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
J3KT08 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3KT08 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
J3KT08 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KT08 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KT08 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KT08 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KT08 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3KT08 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3KT08 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
J3KT08 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3KT08 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3KT08 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3KT08 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3KT08 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KT08 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KT08 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KT08 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KT08 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KT08 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KT08 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KT08 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KT08 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KT08 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KT08 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KT08 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KT08 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KT08 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
J3KT08 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3KT08 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3KT08 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3KT08 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
J3KT08 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KT08 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KT08 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KT08 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KT08 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KT08 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KT08 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KT08 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
J3KT08 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KT08 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KT08 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KT08 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KT08 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KT08 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KT08 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KT08 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
J3KT08 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3KT08 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3KT08 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
J3KT08 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3KT08 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3KT08 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
J3KT08 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3KT08 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3KT08 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3KT08 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
J3KT08 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3KT08 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3KT08 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3KT08 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3KT08 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3KT08 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3KT08 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3KT08 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3KT08 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3KT08 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3KT08 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3KT08 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3KT08 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3KT08 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3KT08 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3KT08 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KT08 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KT08 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KT08 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KT08 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KT08 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KT08 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KT08 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KT08 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KT08 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KT08 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KT08 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KT08 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KT08 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KT08 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KT08 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KT08 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KT08 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KT08 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3KT08 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3KT08 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
J3KT08 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms