Protein–RNA interactions for Protein: H3BMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMQ9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BMQ9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BMQ9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BMQ9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BMQ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BMQ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BMQ9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BMQ9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BMQ9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BMQ9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BMQ9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BMQ9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H3BMQ9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BMQ9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BMQ9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BMQ9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H3BMQ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BMQ9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BMQ9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BMQ9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BMQ9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BMQ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BMQ9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BMQ9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BMQ9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BMQ9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BMQ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BMQ9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BMQ9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BMQ9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BMQ9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BMQ9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BMQ9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BMQ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BMQ9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BMQ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BMQ9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BMQ9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BMQ9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BMQ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BMQ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BMQ9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BMQ9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BMQ9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BMQ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BMQ9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BMQ9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BMQ9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BMQ9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BMQ9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H3BMQ9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H3BMQ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H3BMQ9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H3BMQ9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BMQ9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BMQ9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BMQ9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BMQ9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BMQ9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BMQ9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BMQ9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BMQ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BMQ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H3BMQ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H3BMQ9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BMQ9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BMQ9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BMQ9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BMQ9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BMQ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BMQ9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BMQ9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BMQ9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BMQ9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BMQ9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BMQ9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BMQ9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BMQ9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BMQ9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BMQ9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BMQ9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BMQ9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BMQ9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BMQ9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BMQ9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BMQ9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BMQ9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BMQ9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BMQ9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BMQ9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H3BMQ9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BMQ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H3BMQ9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BMQ9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BMQ9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BMQ9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BMQ9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BMQ9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BMQ9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H3BMQ9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms