Protein–RNA interactions for Protein: A6NJ88

SAGE2P, Putative SAGE1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAGE2PA6NJ88 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAGE2PA6NJ88 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SAGE2PA6NJ88 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SAGE2PA6NJ88 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SAGE2PA6NJ88 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SAGE2PA6NJ88 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SAGE2PA6NJ88 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms