Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RRN3P1Q2M238 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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RRN3P1Q2M238 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RRN3P1Q2M238 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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RRN3P1Q2M238 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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