RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.65■■■■■ 5.38
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.99■■■■■ 4.47
HOXA4-202ENST00000428284 ABCC9O60706 1549 aa41.33■■■■■ 4.21
HOXA4-202ENST00000428284 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
HOXA4-202ENST00000428284 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.4■■■■■ 4.06
HOXA4-202ENST00000428284 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.26■■■■■ 4.04
HOXA4-202ENST00000428284 NACADO15069 1562 aa40.18■■■■■ 4.02
HOXA4-202ENST00000428284 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.13■■■■■ 4.01
HOXA4-202ENST00000428284 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.08■■■■■ 4.01
HOXA4-202ENST00000428284 SCRIBQ14160 1630 aa39.32■■■■□ 3.89
HOXA4-202ENST00000428284 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.31■■■■□ 3.88
HOXA4-202ENST00000428284 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.96■■■■□ 3.83
HOXA4-202ENST00000428284 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.82■■■■□ 3.81
HOXA4-202ENST00000428284 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.71■■■■□ 3.79
HOXA4-202ENST00000428284 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.02■■■■□ 3.68
HOXA4-202ENST00000428284 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.82■■■■□ 3.65
HOXA4-202ENST00000428284 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
HOXA4-202ENST00000428284 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.68■■■■□ 3.62
HOXA4-202ENST00000428284 SMARCA4P51532 1647 aa37.65■■■■□ 3.62
HOXA4-202ENST00000428284 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.52■■■■□ 3.6
HOXA4-202ENST00000428284 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.44■■■■□ 3.58
HOXA4-202ENST00000428284 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
HOXA4-202ENST00000428284 WIZO95785 1651 aa37.23■■■■□ 3.55
HOXA4-202ENST00000428284 SMARCA2P51531 1590 aa37.22■■■■□ 3.55
HOXA4-202ENST00000428284 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.22■■■■□ 3.55
HOXA4-202ENST00000428284 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.19■■■■□ 3.54
HOXA4-202ENST00000428284 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
HOXA4-202ENST00000428284 NCAPD3P42695 1498 aa37.02■■■■□ 3.52
HOXA4-202ENST00000428284 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
HOXA4-202ENST00000428284 HMGXB3Q12766 1538 aa36.97■■■■□ 3.51
HOXA4-202ENST00000428284 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.36■■■■□ 3.41
HOXA4-202ENST00000428284 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.99■■■■□ 3.35
HOXA4-202ENST00000428284 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.99■■■■□ 3.35
HOXA4-202ENST00000428284 NESP48681 1621 aa35.98■■■■□ 3.35
HOXA4-202ENST00000428284 CFTRP13569 1480 aa35.95■■■■□ 3.34
HOXA4-202ENST00000428284 PRDM2Q13029 1718 aa35.92■■■■□ 3.34
HOXA4-202ENST00000428284 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.69■■■■□ 3.3
HOXA4-202ENST00000428284 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.67■■■■□ 3.3
HOXA4-202ENST00000428284 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.62■■■■□ 3.29
HOXA4-202ENST00000428284 ERCC6Q03468 1493 aa35.58■■■■□ 3.29
HOXA4-202ENST00000428284 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.53■■■■□ 3.28
HOXA4-202ENST00000428284 ABCC8Q09428 1581 aa35.34■■■■□ 3.25
HOXA4-202ENST00000428284 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.3■■■■□ 3.24
HOXA4-202ENST00000428284 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
HOXA4-202ENST00000428284 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
HOXA4-202ENST00000428284 CUX2O14529 1486 aa35.23■■■■□ 3.23
HOXA4-202ENST00000428284 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.21■■■■□ 3.23
HOXA4-202ENST00000428284 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.19■■■■□ 3.22
HOXA4-202ENST00000428284 WDR62O43379 1518 aa35.17■■■■□ 3.22
HOXA4-202ENST00000428284 CUX1P39880 1505 aa35.17■■■■□ 3.22
HOXA4-202ENST00000428284 TOPBP1Q92547 1522 aa35.15■■■■□ 3.22
HOXA4-202ENST00000428284 SYNJ1O43426 1573 aa35.13■■■■□ 3.21
HOXA4-202ENST00000428284 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.09■■■■□ 3.21
HOXA4-202ENST00000428284 TOP2BQ02880 1626 aa35.08■■■■□ 3.21
HOXA4-202ENST00000428284 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.94■■■■□ 3.18
HOXA4-202ENST00000428284 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.92■■■■□ 3.18
HOXA4-202ENST00000428284 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM41Q8WV44 630 aa34.9■■■■□ 3.18
HOXA4-202ENST00000428284 SOGA1O94964 1423 aa34.75■■■■□ 3.15
HOXA4-202ENST00000428284 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.74■■■■□ 3.15
HOXA4-202ENST00000428284 IFT140Q96RY7 1462 aa34.72■■■■□ 3.15
HOXA4-202ENST00000428284 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
HOXA4-202ENST00000428284 WDR97A6NE52 1622 aa34.67■■■■□ 3.14
HOXA4-202ENST00000428284 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.61■■■■□ 3.13
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
HOXA4-202ENST00000428284 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
HOXA4-202ENST00000428284 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
HOXA4-202ENST00000428284 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.46■■■■□ 3.11
HOXA4-202ENST00000428284 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.41■■■■□ 3.1
HOXA4-202ENST00000428284 KIF27Q86VH2 1401 aa34.41■■■■□ 3.1
HOXA4-202ENST00000428284 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.38■■■■□ 3.09
HOXA4-202ENST00000428284 PBRM1Q86U86 1689 aa34.37■■■■□ 3.09
HOXA4-202ENST00000428284 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.34■■■■□ 3.09
HOXA4-202ENST00000428284 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.29■■■■□ 3.08
HOXA4-202ENST00000428284 GRIN2BQ13224 1484 aa34.26■■■■□ 3.08
HOXA4-202ENST00000428284 EEA1Q15075 1411 aa34.23■■■■□ 3.07
HOXA4-202ENST00000428284 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.22■■■■□ 3.07
HOXA4-202ENST00000428284 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
HOXA4-202ENST00000428284 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.14■■■■□ 3.06
HOXA4-202ENST00000428284 IGF1RP08069 1367 aa34.12■■■■□ 3.05
HOXA4-202ENST00000428284 CUL7Q14999 1698 aa34.11■■■■□ 3.05
HOXA4-202ENST00000428284 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
HOXA4-202ENST00000428284 ADAMTS12P58397 1594 aa34.08■■■■□ 3.05
HOXA4-202ENST00000428284 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.06■■■■□ 3.04
HOXA4-202ENST00000428284 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.98■■■■□ 3.03
HOXA4-202ENST00000428284 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.97■■■■□ 3.03
HOXA4-202ENST00000428284 CHD1O14646 1710 aa33.96■■■■□ 3.03
HOXA4-202ENST00000428284 SYNJ2O15056 1496 aa33.95■■■■□ 3.03
HOXA4-202ENST00000428284 PRXQ9BXM0 1461 aa33.92■■■■□ 3.02
HOXA4-202ENST00000428284 FBLN2P98095 1184 aa33.89■■■■□ 3.02
HOXA4-202ENST00000428284 KIF21BO75037 1637 aa33.89■■■■□ 3.02
HOXA4-202ENST00000428284 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.88■■■■□ 3.01
HOXA4-202ENST00000428284 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.87■■■■□ 3.01
HOXA4-202ENST00000428284 OSCARQ8IYS5 282 aa33.84■■■■□ 3.01
HOXA4-202ENST00000428284 GRIN2AQ12879 1464 aa33.83■■■■□ 3.01
HOXA4-202ENST00000428284 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.75■■■□□ 2.99
HOXA4-202ENST00000428284 GOLGA3Q08378 1498 aa33.72■■■□□ 2.99
HOXA4-202ENST00000428284 CEP170Q5SW79 1584 aa33.66■■■□□ 2.98
HOXA4-202ENST00000428284 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.64■■■□□ 2.98
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