RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369489.9

CD58-202, Transcript of CD58 molecule, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CD58, Length 1,098 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58-202ENST00000369489 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.1■■■■■ 5.61
CD58-202ENST00000369489 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.53■■■■■ 4.72
CD58-202ENST00000369489 ABCC9O60706 1549 aa43.39■■■■■ 4.54
CD58-202ENST00000369489 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.86■■■■■ 4.29
CD58-202ENST00000369489 NACADO15069 1562 aa41.84■■■■■ 4.29
CD58-202ENST00000369489 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
CD58-202ENST00000369489 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.75■■■■■ 4.27
CD58-202ENST00000369489 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.65■■■■■ 4.26
CD58-202ENST00000369489 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.5■■■■■ 4.23
CD58-202ENST00000369489 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.84■■■■■ 4.13
CD58-202ENST00000369489 SCRIBQ14160 1630 aa40.58■■■■■ 4.09
CD58-202ENST00000369489 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.54■■■■■ 4.08
CD58-202ENST00000369489 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.53■■■■■ 4.08
CD58-202ENST00000369489 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.23■■■■■ 4.03
CD58-202ENST00000369489 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
CD58-202ENST00000369489 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.67■■■■□ 3.94
CD58-202ENST00000369489 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
CD58-202ENST00000369489 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.28■■■■□ 3.88
CD58-202ENST00000369489 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.01■■■■□ 3.84
CD58-202ENST00000369489 SMARCA4P51532 1647 aa38.85■■■■□ 3.81
CD58-202ENST00000369489 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.85■■■■□ 3.81
CD58-202ENST00000369489 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.77■■■■□ 3.8
CD58-202ENST00000369489 SMARCA2P51531 1590 aa38.61■■■■□ 3.77
CD58-202ENST00000369489 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.6■■■■□ 3.77
CD58-202ENST00000369489 NCAPD3P42695 1498 aa38.59■■■■□ 3.77
CD58-202ENST00000369489 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.57■■■■□ 3.77
CD58-202ENST00000369489 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.49■■■■□ 3.75
CD58-202ENST00000369489 HMGXB3Q12766 1538 aa38.43■■■■□ 3.74
CD58-202ENST00000369489 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.32■■■■□ 3.72
CD58-202ENST00000369489 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.19■■■■□ 3.7
CD58-202ENST00000369489 WIZO95785 1651 aa38.16■■■■□ 3.7
CD58-202ENST00000369489 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
CD58-202ENST00000369489 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.57■■■■□ 3.6
CD58-202ENST00000369489 NESP48681 1621 aa37.57■■■■□ 3.6
CD58-202ENST00000369489 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.46■■■■□ 3.59
CD58-202ENST00000369489 ERCC6Q03468 1493 aa37.45■■■■□ 3.59
CD58-202ENST00000369489 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.33■■■■□ 3.57
CD58-202ENST00000369489 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.32■■■■□ 3.56
CD58-202ENST00000369489 CFTRP13569 1480 aa37.26■■■■□ 3.56
CD58-202ENST00000369489 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.56
CD58-202ENST00000369489 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.15■■■■□ 3.54
CD58-202ENST00000369489 CUX2O14529 1486 aa37.04■■■■□ 3.52
CD58-202ENST00000369489 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.03■■■■□ 3.52
CD58-202ENST00000369489 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
CD58-202ENST00000369489 PRDM2Q13029 1718 aa37.01■■■■□ 3.51
CD58-202ENST00000369489 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.99■■■■□ 3.51
CD58-202ENST00000369489 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.92■■■■□ 3.5
CD58-202ENST00000369489 WDR62O43379 1518 aa36.79■■■■□ 3.48
CD58-202ENST00000369489 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
CD58-202ENST00000369489 ABCC8Q09428 1581 aa36.5■■■■□ 3.43
CD58-202ENST00000369489 TOPBP1Q92547 1522 aa36.44■■■■□ 3.42
CD58-202ENST00000369489 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.44■■■■□ 3.42
CD58-202ENST00000369489 IFT140Q96RY7 1462 aa36.22■■■■□ 3.39
CD58-202ENST00000369489 CUX1P39880 1505 aa36.18■■■■□ 3.38
CD58-202ENST00000369489 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
CD58-202ENST00000369489 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.07■■■■□ 3.37
CD58-202ENST00000369489 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.03■■■■□ 3.36
CD58-202ENST00000369489 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
CD58-202ENST00000369489 SOGA1O94964 1423 aa36■■■■□ 3.35
CD58-202ENST00000369489 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
CD58-202ENST00000369489 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.95■■■■□ 3.35
CD58-202ENST00000369489 TOP2BQ02880 1626 aa35.94■■■■□ 3.34
CD58-202ENST00000369489 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.94■■■■□ 3.34
CD58-202ENST00000369489 SYNJ1O43426 1573 aa35.9■■■■□ 3.34
CD58-202ENST00000369489 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
CD58-202ENST00000369489 WDR97A6NE52 1622 aa35.83■■■■□ 3.33
CD58-202ENST00000369489 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.8■■■■□ 3.321e-7■■■□□ 14.7
CD58-202ENST00000369489 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
CD58-202ENST00000369489 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.75■■■■□ 3.31
CD58-202ENST00000369489 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.72■■■■□ 3.31
CD58-202ENST00000369489 GRIN2BQ13224 1484 aa35.59■■■■□ 3.29
CD58-202ENST00000369489 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.59■■■■□ 3.29
CD58-202ENST00000369489 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.58■■■■□ 3.29
CD58-202ENST00000369489 PBRM1Q86U86 1689 aa35.5■■■■□ 3.27
CD58-202ENST00000369489 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.5■■■■□ 3.27
CD58-202ENST00000369489 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
CD58-202ENST00000369489 OSCARQ8IYS5 282 aa35.49■■■■□ 3.27
CD58-202ENST00000369489 CHD1O14646 1710 aa35.4■■■■□ 3.26
CD58-202ENST00000369489 FBLN2P98095 1184 aa35.36■■■■□ 3.25
CD58-202ENST00000369489 SYNJ2O15056 1496 aa35.35■■■■□ 3.25
CD58-202ENST00000369489 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.33■■■■□ 3.25
CD58-202ENST00000369489 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
CD58-202ENST00000369489 KIF27Q86VH2 1401 aa35.29■■■■□ 3.24
CD58-202ENST00000369489 ADAMTS12P58397 1594 aa35.25■■■■□ 3.23
CD58-202ENST00000369489 TRIM41Q8WV44 630 aa35.23■■■■□ 3.23
CD58-202ENST00000369489 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.2■■■■□ 3.23
CD58-202ENST00000369489 GRIN2AQ12879 1464 aa35.12■■■■□ 3.21
CD58-202ENST00000369489 IGF1RP08069 1367 aa35.08■■■■□ 3.21
CD58-202ENST00000369489 CUL7Q14999 1698 aa35.05■■■■□ 3.2
CD58-202ENST00000369489 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.04■■■■□ 3.2
CD58-202ENST00000369489 NUP160Q12769 1436 aa34.96■■■■□ 3.19
CD58-202ENST00000369489 CEP170Q5SW79 1584 aa34.92■■■■□ 3.18
CD58-202ENST00000369489 ARHGEF11O15085 1522 aa34.91■■■■□ 3.18
CD58-202ENST00000369489 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.91■■■■□ 3.18
CD58-202ENST00000369489 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.89■■■■□ 3.18
CD58-202ENST00000369489 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.89■■■■□ 3.18
CD58-202ENST00000369489 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.89■■■■□ 3.18
CD58-202ENST00000369489 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.89■■■■□ 3.18
CD58-202ENST00000369489 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.71■■■■□ 3.15
CD58-202ENST00000369489 EEA1Q15075 1411 aa34.71■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms