RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542296.6

CERS1-202, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 1,947 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-202ENST00000542296 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.35■■■■■ 5.17
CERS1-202ENST00000542296 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.38■■■■■ 4.22
CERS1-202ENST00000542296 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
CERS1-202ENST00000542296 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.24■■■■□ 3.87
CERS1-202ENST00000542296 ABCC9O60706 1549 aa39.01■■■■□ 3.83
CERS1-202ENST00000542296 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.88■■■■□ 3.81
CERS1-202ENST00000542296 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.84■■■■□ 3.81
CERS1-202ENST00000542296 NACADO15069 1562 aa38.54■■■■□ 3.76
CERS1-202ENST00000542296 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.35■■■■□ 3.73
CERS1-202ENST00000542296 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.18■■■■□ 3.7
CERS1-202ENST00000542296 SCRIBQ14160 1630 aa37.9■■■■□ 3.66
CERS1-202ENST00000542296 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.45■■■■□ 3.59
CERS1-202ENST00000542296 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.06■■■■□ 3.52
CERS1-202ENST00000542296 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
CERS1-202ENST00000542296 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.74■■■■□ 3.47
CERS1-202ENST00000542296 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.73■■■■□ 3.47
CERS1-202ENST00000542296 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
CERS1-202ENST00000542296 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
CERS1-202ENST00000542296 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.54■■■■□ 3.44
CERS1-202ENST00000542296 SMARCA4P51532 1647 aa36.41■■■■□ 3.42
CERS1-202ENST00000542296 WIZO95785 1651 aa36.23■■■■□ 3.39
CERS1-202ENST00000542296 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.05■■■■□ 3.36
CERS1-202ENST00000542296 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
CERS1-202ENST00000542296 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
CERS1-202ENST00000542296 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.82■■■■□ 3.32
CERS1-202ENST00000542296 SMARCA2P51531 1590 aa35.81■■■■□ 3.32
CERS1-202ENST00000542296 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
CERS1-202ENST00000542296 NCAPD3P42695 1498 aa35.57■■■■□ 3.28
CERS1-202ENST00000542296 HMGXB3Q12766 1538 aa35.52■■■■□ 3.28
CERS1-202ENST00000542296 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.5■■■■□ 3.27
CERS1-202ENST00000542296 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.38■■■■□ 3.25
CERS1-202ENST00000542296 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.38■■■■□ 3.25
CERS1-202ENST00000542296 TRIM41Q8WV44 630 aa34.75■■■■□ 3.15
CERS1-202ENST00000542296 CFTRP13569 1480 aa34.74■■■■□ 3.15
CERS1-202ENST00000542296 ABCC8Q09428 1581 aa34.67■■■■□ 3.14
CERS1-202ENST00000542296 PRDM2Q13029 1718 aa34.61■■■■□ 3.13
CERS1-202ENST00000542296 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.6■■■■□ 3.13
CERS1-202ENST00000542296 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.5■■■■□ 3.11
CERS1-202ENST00000542296 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.47■■■■□ 3.11
CERS1-202ENST00000542296 SYNJ1O43426 1573 aa34.37■■■■□ 3.09
CERS1-202ENST00000542296 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.36■■■■□ 3.09
CERS1-202ENST00000542296 TOP2BQ02880 1626 aa34.29■■■■□ 3.08
CERS1-202ENST00000542296 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.27■■■■□ 3.08
CERS1-202ENST00000542296 NESP48681 1621 aa34.25■■■■□ 3.07
CERS1-202ENST00000542296 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.19■■■■□ 3.06
CERS1-202ENST00000542296 CUX1P39880 1505 aa34.17■■■■□ 3.06
CERS1-202ENST00000542296 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.05■■■■□ 3.04
CERS1-202ENST00000542296 EEA1Q15075 1411 aa34.03■■■■□ 3.04
CERS1-202ENST00000542296 SOGA1O94964 1423 aa34.02■■■■□ 3.04
CERS1-202ENST00000542296 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
CERS1-202ENST00000542296 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.98■■■■□ 3.03
CERS1-202ENST00000542296 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.94■■■■□ 3.02
CERS1-202ENST00000542296 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.91■■■■□ 3.02
CERS1-202ENST00000542296 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.9■■■■□ 3.02
CERS1-202ENST00000542296 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.9■■■■□ 3.02
CERS1-202ENST00000542296 TOPBP1Q92547 1522 aa33.83■■■■□ 3.01
CERS1-202ENST00000542296 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.79■■■■□ 3
CERS1-202ENST00000542296 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.78■■■■□ 3
CERS1-202ENST00000542296 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.77■■■■□ 3
CERS1-202ENST00000542296 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
CERS1-202ENST00000542296 KIF27Q86VH2 1401 aa33.64■■■□□ 2.98
CERS1-202ENST00000542296 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.6■■■□□ 2.97
CERS1-202ENST00000542296 KIF21BO75037 1637 aa33.59■■■□□ 2.97
CERS1-202ENST00000542296 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.55■■■□□ 2.96
CERS1-202ENST00000542296 CUX2O14529 1486 aa33.53■■■□□ 2.96
CERS1-202ENST00000542296 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.5■■■□□ 2.95
CERS1-202ENST00000542296 GOLGA3Q08378 1498 aa33.49■■■□□ 2.95
CERS1-202ENST00000542296 WDR62O43379 1518 aa33.48■■■□□ 2.95
CERS1-202ENST00000542296 WDR97A6NE52 1622 aa33.47■■■□□ 2.95
CERS1-202ENST00000542296 ERCC6Q03468 1493 aa33.45■■■□□ 2.94
CERS1-202ENST00000542296 PRXQ9BXM0 1461 aa33.45■■■□□ 2.94
CERS1-202ENST00000542296 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.43■■■□□ 2.94
CERS1-202ENST00000542296 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.4■■■□□ 2.94
CERS1-202ENST00000542296 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.39■■■□□ 2.94
CERS1-202ENST00000542296 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
CERS1-202ENST00000542296 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
CERS1-202ENST00000542296 IGF1RP08069 1367 aa33.37■■■□□ 2.93
CERS1-202ENST00000542296 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.34■■■□□ 2.93
CERS1-202ENST00000542296 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.29■■■□□ 2.92
CERS1-202ENST00000542296 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
CERS1-202ENST00000542296 IFT140Q96RY7 1462 aa33.2■■■□□ 2.9
CERS1-202ENST00000542296 CEP162Q5TB80 1403 aa33.17■■■□□ 2.9
CERS1-202ENST00000542296 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.17■■■□□ 2.9
CERS1-202ENST00000542296 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.17■■■□□ 2.9
CERS1-202ENST00000542296 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
CERS1-202ENST00000542296 CUL7Q14999 1698 aa33.15■■■□□ 2.9
CERS1-202ENST00000542296 PBRM1Q86U86 1689 aa33.02■■■□□ 2.88
CERS1-202ENST00000542296 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.98■■■□□ 2.87
CERS1-202ENST00000542296 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
CERS1-202ENST00000542296 GRIN2BQ13224 1484 aa32.93■■■□□ 2.86
CERS1-202ENST00000542296 CLIP1P30622 1438 aa32.93■■■□□ 2.86
CERS1-202ENST00000542296 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.9■■■□□ 2.86
CERS1-202ENST00000542296 ADAMTS12P58397 1594 aa32.83■■■□□ 2.85
CERS1-202ENST00000542296 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.83■■■□□ 2.85
CERS1-202ENST00000542296 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.76■■■□□ 2.84
CERS1-202ENST00000542296 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.69■■■□□ 2.82
CERS1-202ENST00000542296 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.68■■■□□ 2.82
CERS1-202ENST00000542296 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.67■■■□□ 2.82
CERS1-202ENST00000542296 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.67■■■□□ 2.82
CERS1-202ENST00000542296 ARAP1Q96P48 1450 aa32.65■■■□□ 2.82
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