Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NECAP2Q9NVZ3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms