RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.4■■■□□ 2.62
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HOXA13-201ENST00000222753 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.98■■■□□ 2.23
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HOXA13-201ENST00000222753 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
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HOXA13-201ENST00000222753 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
HOXA13-201ENST00000222753 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
HOXA13-201ENST00000222753 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.94■■■□□ 2.06
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HOXA13-201ENST00000222753 NEFLP07196 543 aa27.67■■■□□ 2.02
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HOXA13-201ENST00000222753 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXA13-201ENST00000222753 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
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HOXA13-201ENST00000222753 BCANQ96GW7 911 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXA13-201ENST00000222753 ANP32CO43423 234 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXA13-201ENST00000222753 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
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HOXA13-201ENST00000222753 NEUROD1Q13562 356 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXA13-201ENST00000222753 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
HOXA13-201ENST00000222753 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.96■■□□□ 1.75
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HOXA13-201ENST00000222753 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
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HOXA13-201ENST00000222753 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.62■■□□□ 1.69
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HOXA13-201ENST00000222753 P3H3Q8IVL6 736 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXA13-201ENST00000222753 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
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HOXA13-201ENST00000222753 EEA1Q15075 1411 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXA13-201ENST00000222753 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
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HOXA13-201ENST00000222753 CLIP1P30622 1438 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA13-201ENST00000222753 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXA13-201ENST00000222753 ARID3CA6NKF2 412 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXA13-201ENST00000222753 CEP162Q5TB80 1403 aa25.13■■□□□ 1.61
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HOXA13-201ENST00000222753 GOLGA3Q08378 1498 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXA13-201ENST00000222753 NBR1Q14596 966 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXA13-201ENST00000222753 MRS2Q9HD23 443 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXA13-201ENST00000222753 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXA13-201ENST00000222753 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
HOXA13-201ENST00000222753 TMC1Q8TDI8 760 aa25■■□□□ 1.59
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
HOXA13-201ENST00000222753 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa24.96■■□□□ 1.59
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HOXA13-201ENST00000222753 NEFMP07197 916 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXA13-201ENST00000222753 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXA13-201ENST00000222753 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
HOXA13-201ENST00000222753 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
HOXA13-201ENST00000222753 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
HOXA13-201ENST00000222753 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXA13-201ENST00000222753 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXA13-201ENST00000222753 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
HOXA13-201ENST00000222753 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
HOXA13-201ENST00000222753 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXA13-201ENST00000222753 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXA13-201ENST00000222753 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXA13-201ENST00000222753 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXA13-201ENST00000222753 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXA13-201ENST00000222753 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
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