Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KRTAP25-1Q3LHN0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms