RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262764.10

PGS1-201, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGS1, Length 2,201 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-201ENST00000262764 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.3■■■■■ 4.2
PGS1-201ENST00000262764 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.42■■■■□ 3.26
PGS1-201ENST00000262764 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
PGS1-201ENST00000262764 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.63■■■■□ 3.13
PGS1-201ENST00000262764 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.04■■■■□ 3.04
PGS1-201ENST00000262764 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.93■■■■□ 3.02
PGS1-201ENST00000262764 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
PGS1-201ENST00000262764 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.22■■■□□ 2.91
PGS1-201ENST00000262764 SCRIBQ14160 1630 aa32.91■■■□□ 2.86
PGS1-201ENST00000262764 ABCC9O60706 1549 aa32.89■■■□□ 2.85
PGS1-201ENST00000262764 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.84■■■□□ 2.85
PGS1-201ENST00000262764 NACADO15069 1562 aa32.76■■■□□ 2.84
PGS1-201ENST00000262764 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
PGS1-201ENST00000262764 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.26■■■□□ 2.75
PGS1-201ENST00000262764 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.12■■■□□ 2.73
PGS1-201ENST00000262764 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.02■■■□□ 2.72
PGS1-201ENST00000262764 WIZO95785 1651 aa31.82■■■□□ 2.69
PGS1-201ENST00000262764 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
PGS1-201ENST00000262764 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.75■■■□□ 2.67
PGS1-201ENST00000262764 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.71■■■□□ 2.67
PGS1-201ENST00000262764 TRIM41Q8WV44 630 aa31.6■■■□□ 2.65
PGS1-201ENST00000262764 SMARCA4P51532 1647 aa31.54■■■□□ 2.64
PGS1-201ENST00000262764 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
PGS1-201ENST00000262764 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
PGS1-201ENST00000262764 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.37■■■□□ 2.61
PGS1-201ENST00000262764 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.33■■■□□ 2.61
PGS1-201ENST00000262764 HRCP23327 699 aa31.23■■■□□ 2.59
PGS1-201ENST00000262764 SMARCA2P51531 1590 aa31.21■■■□□ 2.59
PGS1-201ENST00000262764 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.19■■■□□ 2.58
PGS1-201ENST00000262764 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.18■■■□□ 2.58
PGS1-201ENST00000262764 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
PGS1-201ENST00000262764 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.04■■■□□ 2.56
PGS1-201ENST00000262764 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
PGS1-201ENST00000262764 ABCC8Q09428 1581 aa30.94■■■□□ 2.54
PGS1-201ENST00000262764 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.79■■■□□ 2.52
PGS1-201ENST00000262764 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.77■■■□□ 2.52
PGS1-201ENST00000262764 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
PGS1-201ENST00000262764 SOGA1O94964 1423 aa30.57■■■□□ 2.48
PGS1-201ENST00000262764 EEA1Q15075 1411 aa30.54■■■□□ 2.48
PGS1-201ENST00000262764 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.53■■■□□ 2.48
PGS1-201ENST00000262764 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
PGS1-201ENST00000262764 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.42■■■□□ 2.46
PGS1-201ENST00000262764 SYNJ1O43426 1573 aa30.4■■■□□ 2.46
PGS1-201ENST00000262764 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.37■■■□□ 2.45
PGS1-201ENST00000262764 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.35■■■□□ 2.45
PGS1-201ENST00000262764 CEP162Q5TB80 1403 aa30.31■■■□□ 2.44
PGS1-201ENST00000262764 HMGXB3Q12766 1538 aa30.31■■■□□ 2.44
PGS1-201ENST00000262764 NCAPD3P42695 1498 aa30.28■■■□□ 2.44
PGS1-201ENST00000262764 GOLGA3Q08378 1498 aa30.24■■■□□ 2.43
PGS1-201ENST00000262764 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
PGS1-201ENST00000262764 KIF21BO75037 1637 aa30.14■■■□□ 2.42
PGS1-201ENST00000262764 TOP2BQ02880 1626 aa30.13■■■□□ 2.41
PGS1-201ENST00000262764 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.12■■■□□ 2.41
PGS1-201ENST00000262764 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
PGS1-201ENST00000262764 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.07■■■□□ 2.4
PGS1-201ENST00000262764 CFTRP13569 1480 aa29.92■■■□□ 2.38
PGS1-201ENST00000262764 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.87■■■□□ 2.37
PGS1-201ENST00000262764 CUX1P39880 1505 aa29.86■■■□□ 2.37
PGS1-201ENST00000262764 CLIP1P30622 1438 aa29.82■■■□□ 2.36
PGS1-201ENST00000262764 PRDM2Q13029 1718 aa29.77■■■□□ 2.36
PGS1-201ENST00000262764 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
PGS1-201ENST00000262764 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.73■■■□□ 2.35
PGS1-201ENST00000262764 PRXQ9BXM0 1461 aa29.72■■■□□ 2.35
PGS1-201ENST00000262764 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.7■■■□□ 2.35
PGS1-201ENST00000262764 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
PGS1-201ENST00000262764 KIF27Q86VH2 1401 aa29.63■■■□□ 2.33
PGS1-201ENST00000262764 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.63■■■□□ 2.33
PGS1-201ENST00000262764 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
PGS1-201ENST00000262764 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.61■■■□□ 2.33
PGS1-201ENST00000262764 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
PGS1-201ENST00000262764 ARAP1Q96P48 1450 aa29.43■■■□□ 2.3
PGS1-201ENST00000262764 APLP2Q06481 763 aa29.4■■■□□ 2.3
PGS1-201ENST00000262764 CUX2O14529 1486 aa29.37■■■□□ 2.29
PGS1-201ENST00000262764 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.36■■■□□ 2.29
PGS1-201ENST00000262764 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.31■■■□□ 2.28
PGS1-201ENST00000262764 IGF1RP08069 1367 aa29.3■■■□□ 2.28
PGS1-201ENST00000262764 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.23■■■□□ 2.27
PGS1-201ENST00000262764 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.2■■■□□ 2.27
PGS1-201ENST00000262764 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
PGS1-201ENST00000262764 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.17■■■□□ 2.26
PGS1-201ENST00000262764 NESP48681 1621 aa29.13■■■□□ 2.25
PGS1-201ENST00000262764 TOPBP1Q92547 1522 aa29.11■■■□□ 2.25
PGS1-201ENST00000262764 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
PGS1-201ENST00000262764 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.08■■■□□ 2.25
PGS1-201ENST00000262764 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
PGS1-201ENST00000262764 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.06■■■□□ 2.24
PGS1-201ENST00000262764 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.04■■■□□ 2.24
PGS1-201ENST00000262764 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
PGS1-201ENST00000262764 MAP3K1Q13233 1512 aa28.92■■■□□ 2.22
PGS1-201ENST00000262764 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PGS1-201ENST00000262764 CUL7Q14999 1698 aa28.9■■■□□ 2.22
PGS1-201ENST00000262764 WDR97A6NE52 1622 aa28.89■■■□□ 2.22
PGS1-201ENST00000262764 TIAM1Q13009 1591 aa28.89■■■□□ 2.21
PGS1-201ENST00000262764 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
PGS1-201ENST00000262764 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.82■■■□□ 2.2
PGS1-201ENST00000262764 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.81■■■□□ 2.2
PGS1-201ENST00000262764 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.81■■■□□ 2.2
PGS1-201ENST00000262764 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
PGS1-201ENST00000262764 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.77■■■□□ 2.2
PGS1-201ENST00000262764 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.77■■■□□ 2.2
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