RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.06■■■■■ 4.96
CLN8-208ENST00000635751 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.51■■■■■ 4.08
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CLN8-208ENST00000635751 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
CLN8-208ENST00000635751 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.27■■■■□ 3.72
CLN8-208ENST00000635751 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.07■■■■□ 3.69
CLN8-208ENST00000635751 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.86■■■■□ 3.65
CLN8-208ENST00000635751 NACADO15069 1562 aa37.86■■■■□ 3.65
CLN8-208ENST00000635751 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.7■■■■□ 3.63
CLN8-208ENST00000635751 SCRIBQ14160 1630 aa37.14■■■■□ 3.54
CLN8-208ENST00000635751 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.1■■■■□ 3.53
CLN8-208ENST00000635751 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.01■■■■□ 3.52
CLN8-208ENST00000635751 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.57■■■■□ 3.45
CLN8-208ENST00000635751 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.51■■■■□ 3.44
CLN8-208ENST00000635751 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.84■■■■□ 3.33
CLN8-208ENST00000635751 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
CLN8-208ENST00000635751 SMARCA4P51532 1647 aa35.56■■■■□ 3.28
CLN8-208ENST00000635751 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.56■■■■□ 3.28
CLN8-208ENST00000635751 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
CLN8-208ENST00000635751 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
CLN8-208ENST00000635751 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
CLN8-208ENST00000635751 WIZO95785 1651 aa35.28■■■■□ 3.24
CLN8-208ENST00000635751 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.18■■■■□ 3.22
CLN8-208ENST00000635751 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.14■■■■□ 3.22
CLN8-208ENST00000635751 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.12■■■■□ 3.21
CLN8-208ENST00000635751 SMARCA2P51531 1590 aa35.09■■■■□ 3.21
CLN8-208ENST00000635751 NCAPD3P42695 1498 aa34.92■■■■□ 3.18
CLN8-208ENST00000635751 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
CLN8-208ENST00000635751 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.88■■■■□ 3.17
CLN8-208ENST00000635751 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
CLN8-208ENST00000635751 HMGXB3Q12766 1538 aa34.83■■■■□ 3.17
CLN8-208ENST00000635751 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.49■■■■□ 3.11
CLN8-208ENST00000635751 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.98■■■■□ 3.03
CLN8-208ENST00000635751 CFTRP13569 1480 aa33.96■■■■□ 3.03
CLN8-208ENST00000635751 NESP48681 1621 aa33.92■■■■□ 3.02
CLN8-208ENST00000635751 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.88■■■■□ 3.01
CLN8-208ENST00000635751 PRDM2Q13029 1718 aa33.86■■■■□ 3.01
CLN8-208ENST00000635751 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.61■■■□□ 2.97
CLN8-208ENST00000635751 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.6■■■□□ 2.97
CLN8-208ENST00000635751 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.57■■■□□ 2.96
CLN8-208ENST00000635751 ABCC8Q09428 1581 aa33.57■■■□□ 2.96
CLN8-208ENST00000635751 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.51■■■□□ 2.96
CLN8-208ENST00000635751 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.47■■■□□ 2.95
CLN8-208ENST00000635751 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.4■■■□□ 2.94
CLN8-208ENST00000635751 ERCC6Q03468 1493 aa33.38■■■□□ 2.93
CLN8-208ENST00000635751 TRIM41Q8WV44 630 aa33.32■■■□□ 2.92
CLN8-208ENST00000635751 SYNJ1O43426 1573 aa33.32■■■□□ 2.92
CLN8-208ENST00000635751 CUX1P39880 1505 aa33.29■■■□□ 2.92
CLN8-208ENST00000635751 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.24■■■□□ 2.91
CLN8-208ENST00000635751 TOP2BQ02880 1626 aa33.23■■■□□ 2.91
CLN8-208ENST00000635751 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.23■■■□□ 2.91
CLN8-208ENST00000635751 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.21■■■□□ 2.91
CLN8-208ENST00000635751 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.2■■■□□ 2.91
CLN8-208ENST00000635751 TOPBP1Q92547 1522 aa33.18■■■□□ 2.9
CLN8-208ENST00000635751 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.14■■■□□ 2.9
CLN8-208ENST00000635751 WDR62O43379 1518 aa33.07■■■□□ 2.88
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CLN8-208ENST00000635751 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
CLN8-208ENST00000635751 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.86■■■□□ 2.85
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CLN8-208ENST00000635751 CUX2O14529 1486 aa32.82■■■□□ 2.84
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CLN8-208ENST00000635751 WDR97A6NE52 1622 aa32.72■■■□□ 2.83
CLN8-208ENST00000635751 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.72■■■□□ 2.83
CLN8-208ENST00000635751 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.72■■■□□ 2.83
CLN8-208ENST00000635751 IFT140Q96RY7 1462 aa32.7■■■□□ 2.83
CLN8-208ENST00000635751 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.82
CLN8-208ENST00000635751 KIF27Q86VH2 1401 aa32.61■■■□□ 2.81
CLN8-208ENST00000635751 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
CLN8-208ENST00000635751 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
CLN8-208ENST00000635751 EEA1Q15075 1411 aa32.55■■■□□ 2.8
CLN8-208ENST00000635751 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.53■■■□□ 2.8
CLN8-208ENST00000635751 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.5■■■□□ 2.79
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CLN8-208ENST00000635751 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.47■■■□□ 2.79
CLN8-208ENST00000635751 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
CLN8-208ENST00000635751 PBRM1Q86U86 1689 aa32.41■■■□□ 2.78
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CLN8-208ENST00000635751 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.33■■■□□ 2.77
CLN8-208ENST00000635751 GRIN2BQ13224 1484 aa32.32■■■□□ 2.76
CLN8-208ENST00000635751 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.26■■■□□ 2.76
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CLN8-208ENST00000635751 PRXQ9BXM0 1461 aa32.22■■■□□ 2.75
CLN8-208ENST00000635751 KIF21BO75037 1637 aa32.2■■■□□ 2.75
CLN8-208ENST00000635751 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.18■■■□□ 2.74
CLN8-208ENST00000635751 ADAMTS12P58397 1594 aa32.14■■■□□ 2.74
CLN8-208ENST00000635751 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.14■■■□□ 2.74
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CLN8-208ENST00000635751 GOLGA3Q08378 1498 aa32.09■■■□□ 2.73
CLN8-208ENST00000635751 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.72
CLN8-208ENST00000635751 SYNJ2O15056 1496 aa32■■■□□ 2.71
CLN8-208ENST00000635751 FBLN2P98095 1184 aa31.98■■■□□ 2.71
CLN8-208ENST00000635751 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
CLN8-208ENST00000635751 GRIN2AQ12879 1464 aa31.93■■■□□ 2.7
CLN8-208ENST00000635751 CHD1O14646 1710 aa31.93■■■□□ 2.7
CLN8-208ENST00000635751 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.86■■■□□ 2.69
CLN8-208ENST00000635751 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.83■■■□□ 2.69
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