Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G1

PCDHGB3, Protocadherin gamma-B3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB3Q9Y5G1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHGB3Q9Y5G1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHGB3Q9Y5G1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHGB3Q9Y5G1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHGB3Q9Y5G1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHGB3Q9Y5G1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHGB3Q9Y5G1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHGB3Q9Y5G1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHGB3Q9Y5G1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHGB3Q9Y5G1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHGB3Q9Y5G1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHGB3Q9Y5G1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHGB3Q9Y5G1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHGB3Q9Y5G1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHGB3Q9Y5G1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHGB3Q9Y5G1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHGB3Q9Y5G1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHGB3Q9Y5G1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHGB3Q9Y5G1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHGB3Q9Y5G1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHGB3Q9Y5G1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHGB3Q9Y5G1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHGB3Q9Y5G1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHGB3Q9Y5G1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHGB3Q9Y5G1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHGB3Q9Y5G1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHGB3Q9Y5G1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHGB3Q9Y5G1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHGB3Q9Y5G1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHGB3Q9Y5G1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHGB3Q9Y5G1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHGB3Q9Y5G1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHGB3Q9Y5G1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHGB3Q9Y5G1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCDHGB3Q9Y5G1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHGB3Q9Y5G1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHGB3Q9Y5G1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHGB3Q9Y5G1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHGB3Q9Y5G1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHGB3Q9Y5G1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHGB3Q9Y5G1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHGB3Q9Y5G1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHGB3Q9Y5G1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHGB3Q9Y5G1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHGB3Q9Y5G1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHGB3Q9Y5G1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHGB3Q9Y5G1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHGB3Q9Y5G1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHGB3Q9Y5G1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHGB3Q9Y5G1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHGB3Q9Y5G1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHGB3Q9Y5G1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHGB3Q9Y5G1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGB3Q9Y5G1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGB3Q9Y5G1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms