Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLXND1Q9Y4D7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLXND1Q9Y4D7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLXND1Q9Y4D7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLXND1Q9Y4D7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLXND1Q9Y4D7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLXND1Q9Y4D7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLXND1Q9Y4D7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLXND1Q9Y4D7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLXND1Q9Y4D7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLXND1Q9Y4D7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLXND1Q9Y4D7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLXND1Q9Y4D7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PLXND1Q9Y4D7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLXND1Q9Y4D7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLXND1Q9Y4D7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLXND1Q9Y4D7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLXND1Q9Y4D7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLXND1Q9Y4D7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLXND1Q9Y4D7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLXND1Q9Y4D7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PLXND1Q9Y4D7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLXND1Q9Y4D7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXND1Q9Y4D7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXND1Q9Y4D7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLXND1Q9Y4D7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXND1Q9Y4D7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXND1Q9Y4D7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXND1Q9Y4D7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLXND1Q9Y4D7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLXND1Q9Y4D7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLXND1Q9Y4D7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLXND1Q9Y4D7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLXND1Q9Y4D7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXND1Q9Y4D7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXND1Q9Y4D7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXND1Q9Y4D7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXND1Q9Y4D7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLXND1Q9Y4D7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLXND1Q9Y4D7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXND1Q9Y4D7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXND1Q9Y4D7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXND1Q9Y4D7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXND1Q9Y4D7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PLXND1Q9Y4D7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLXND1Q9Y4D7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLXND1Q9Y4D7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXND1Q9Y4D7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXND1Q9Y4D7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXND1Q9Y4D7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLXND1Q9Y4D7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLXND1Q9Y4D7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLXND1Q9Y4D7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLXND1Q9Y4D7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXND1Q9Y4D7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXND1Q9Y4D7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXND1Q9Y4D7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXND1Q9Y4D7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXND1Q9Y4D7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXND1Q9Y4D7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLXND1Q9Y4D7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXND1Q9Y4D7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXND1Q9Y4D7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXND1Q9Y4D7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXND1Q9Y4D7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXND1Q9Y4D7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXND1Q9Y4D7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXND1Q9Y4D7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXND1Q9Y4D7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PLXND1Q9Y4D7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLXND1Q9Y4D7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PLXND1Q9Y4D7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PLXND1Q9Y4D7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.1 ms