Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FAN1Q9Y2M0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FAN1Q9Y2M0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FAN1Q9Y2M0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAN1Q9Y2M0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAN1Q9Y2M0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FAN1Q9Y2M0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FAN1Q9Y2M0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAN1Q9Y2M0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FAN1Q9Y2M0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FAN1Q9Y2M0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAN1Q9Y2M0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FAN1Q9Y2M0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAN1Q9Y2M0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
FAN1Q9Y2M0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAN1Q9Y2M0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAN1Q9Y2M0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAN1Q9Y2M0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAN1Q9Y2M0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FAN1Q9Y2M0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
FAN1Q9Y2M0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAN1Q9Y2M0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAN1Q9Y2M0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAN1Q9Y2M0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FAN1Q9Y2M0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAN1Q9Y2M0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAN1Q9Y2M0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAN1Q9Y2M0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAN1Q9Y2M0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FAN1Q9Y2M0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FAN1Q9Y2M0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAN1Q9Y2M0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAN1Q9Y2M0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FAN1Q9Y2M0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAN1Q9Y2M0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FAN1Q9Y2M0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FAN1Q9Y2M0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
FAN1Q9Y2M0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
FAN1Q9Y2M0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FAN1Q9Y2M0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FAN1Q9Y2M0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FAN1Q9Y2M0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FAN1Q9Y2M0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FAN1Q9Y2M0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FAN1Q9Y2M0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FAN1Q9Y2M0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FAN1Q9Y2M0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FAN1Q9Y2M0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAN1Q9Y2M0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAN1Q9Y2M0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAN1Q9Y2M0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAN1Q9Y2M0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAN1Q9Y2M0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAN1Q9Y2M0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FAN1Q9Y2M0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAN1Q9Y2M0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAN1Q9Y2M0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAN1Q9Y2M0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAN1Q9Y2M0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAN1Q9Y2M0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAN1Q9Y2M0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAN1Q9Y2M0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAN1Q9Y2M0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAN1Q9Y2M0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAN1Q9Y2M0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAN1Q9Y2M0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAN1Q9Y2M0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAN1Q9Y2M0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAN1Q9Y2M0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAN1Q9Y2M0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAN1Q9Y2M0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAN1Q9Y2M0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAN1Q9Y2M0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAN1Q9Y2M0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAN1Q9Y2M0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAN1Q9Y2M0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAN1Q9Y2M0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAN1Q9Y2M0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAN1Q9Y2M0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAN1Q9Y2M0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAN1Q9Y2M0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAN1Q9Y2M0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAN1Q9Y2M0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAN1Q9Y2M0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAN1Q9Y2M0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAN1Q9Y2M0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FAN1Q9Y2M0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FAN1Q9Y2M0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FAN1Q9Y2M0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FAN1Q9Y2M0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAN1Q9Y2M0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAN1Q9Y2M0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAN1Q9Y2M0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAN1Q9Y2M0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAN1Q9Y2M0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAN1Q9Y2M0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAN1Q9Y2M0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FAN1Q9Y2M0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAN1Q9Y2M0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAN1Q9Y2M0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms