Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIKFYVEQ9Y2I7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PIKFYVEQ9Y2I7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIKFYVEQ9Y2I7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PIKFYVEQ9Y2I7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PIKFYVEQ9Y2I7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIKFYVEQ9Y2I7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIKFYVEQ9Y2I7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PIKFYVEQ9Y2I7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIKFYVEQ9Y2I7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIKFYVEQ9Y2I7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIKFYVEQ9Y2I7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIKFYVEQ9Y2I7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIKFYVEQ9Y2I7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PIKFYVEQ9Y2I7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIKFYVEQ9Y2I7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIKFYVEQ9Y2I7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PIKFYVEQ9Y2I7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIKFYVEQ9Y2I7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIKFYVEQ9Y2I7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PIKFYVEQ9Y2I7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PIKFYVEQ9Y2I7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIKFYVEQ9Y2I7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIKFYVEQ9Y2I7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIKFYVEQ9Y2I7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIKFYVEQ9Y2I7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIKFYVEQ9Y2I7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIKFYVEQ9Y2I7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIKFYVEQ9Y2I7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIKFYVEQ9Y2I7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIKFYVEQ9Y2I7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIKFYVEQ9Y2I7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIKFYVEQ9Y2I7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIKFYVEQ9Y2I7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIKFYVEQ9Y2I7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIKFYVEQ9Y2I7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIKFYVEQ9Y2I7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIKFYVEQ9Y2I7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIKFYVEQ9Y2I7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIKFYVEQ9Y2I7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIKFYVEQ9Y2I7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIKFYVEQ9Y2I7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIKFYVEQ9Y2I7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIKFYVEQ9Y2I7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIKFYVEQ9Y2I7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIKFYVEQ9Y2I7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIKFYVEQ9Y2I7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIKFYVEQ9Y2I7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIKFYVEQ9Y2I7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms