Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
NUDCQ9Y266 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
NUDCQ9Y266 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
NUDCQ9Y266 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NUDCQ9Y266 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NUDCQ9Y266 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NUDCQ9Y266 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NUDCQ9Y266 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NUDCQ9Y266 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NUDCQ9Y266 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NUDCQ9Y266 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NUDCQ9Y266 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NUDCQ9Y266 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NUDCQ9Y266 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NUDCQ9Y266 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NUDCQ9Y266 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NUDCQ9Y266 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NUDCQ9Y266 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NUDCQ9Y266 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NUDCQ9Y266 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NUDCQ9Y266 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NUDCQ9Y266 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NUDCQ9Y266 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NUDCQ9Y266 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NUDCQ9Y266 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NUDCQ9Y266 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NUDCQ9Y266 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NUDCQ9Y266 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NUDCQ9Y266 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NUDCQ9Y266 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NUDCQ9Y266 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NUDCQ9Y266 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NUDCQ9Y266 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NUDCQ9Y266 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NUDCQ9Y266 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NUDCQ9Y266 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NUDCQ9Y266 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NUDCQ9Y266 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NUDCQ9Y266 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NUDCQ9Y266 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NUDCQ9Y266 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NUDCQ9Y266 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NUDCQ9Y266 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NUDCQ9Y266 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NUDCQ9Y266 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NUDCQ9Y266 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NUDCQ9Y266 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NUDCQ9Y266 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NUDCQ9Y266 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NUDCQ9Y266 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NUDCQ9Y266 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
NUDCQ9Y266 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NUDCQ9Y266 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NUDCQ9Y266 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NUDCQ9Y266 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NUDCQ9Y266 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NUDCQ9Y266 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NUDCQ9Y266 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
NUDCQ9Y266 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
NUDCQ9Y266 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NUDCQ9Y266 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NUDCQ9Y266 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NUDCQ9Y266 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NUDCQ9Y266 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NUDCQ9Y266 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NUDCQ9Y266 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NUDCQ9Y266 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NUDCQ9Y266 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NUDCQ9Y266 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NUDCQ9Y266 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NUDCQ9Y266 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NUDCQ9Y266 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
NUDCQ9Y266 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NUDCQ9Y266 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NUDCQ9Y266 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NUDCQ9Y266 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NUDCQ9Y266 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NUDCQ9Y266 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NUDCQ9Y266 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NUDCQ9Y266 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NUDCQ9Y266 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NUDCQ9Y266 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NUDCQ9Y266 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NUDCQ9Y266 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
NUDCQ9Y266 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NUDCQ9Y266 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NUDCQ9Y266 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NUDCQ9Y266 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NUDCQ9Y266 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NUDCQ9Y266 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
NUDCQ9Y266 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUDCQ9Y266 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NUDCQ9Y266 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUDCQ9Y266 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUDCQ9Y266 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUDCQ9Y266 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUDCQ9Y266 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUDCQ9Y266 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUDCQ9Y266 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUDCQ9Y266 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms