Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
HPS5Q9UPZ3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
HPS5Q9UPZ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
HPS5Q9UPZ3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HPS5Q9UPZ3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HPS5Q9UPZ3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HPS5Q9UPZ3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HPS5Q9UPZ3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HPS5Q9UPZ3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
HPS5Q9UPZ3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
HPS5Q9UPZ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
HPS5Q9UPZ3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
HPS5Q9UPZ3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HPS5Q9UPZ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
HPS5Q9UPZ3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HPS5Q9UPZ3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HPS5Q9UPZ3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HPS5Q9UPZ3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HPS5Q9UPZ3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HPS5Q9UPZ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HPS5Q9UPZ3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HPS5Q9UPZ3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HPS5Q9UPZ3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
HPS5Q9UPZ3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
HPS5Q9UPZ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HPS5Q9UPZ3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HPS5Q9UPZ3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HPS5Q9UPZ3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HPS5Q9UPZ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
HPS5Q9UPZ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
HPS5Q9UPZ3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
HPS5Q9UPZ3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
HPS5Q9UPZ3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
HPS5Q9UPZ3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
HPS5Q9UPZ3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HPS5Q9UPZ3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HPS5Q9UPZ3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HPS5Q9UPZ3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HPS5Q9UPZ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HPS5Q9UPZ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HPS5Q9UPZ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HPS5Q9UPZ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HPS5Q9UPZ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HPS5Q9UPZ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HPS5Q9UPZ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HPS5Q9UPZ3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HPS5Q9UPZ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HPS5Q9UPZ3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
HPS5Q9UPZ3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
HPS5Q9UPZ3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
HPS5Q9UPZ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HPS5Q9UPZ3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HPS5Q9UPZ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HPS5Q9UPZ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HPS5Q9UPZ3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HPS5Q9UPZ3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HPS5Q9UPZ3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HPS5Q9UPZ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HPS5Q9UPZ3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HPS5Q9UPZ3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HPS5Q9UPZ3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
HPS5Q9UPZ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HPS5Q9UPZ3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HPS5Q9UPZ3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
HPS5Q9UPZ3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
HPS5Q9UPZ3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HPS5Q9UPZ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HPS5Q9UPZ3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HPS5Q9UPZ3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HPS5Q9UPZ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HPS5Q9UPZ3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HPS5Q9UPZ3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HPS5Q9UPZ3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HPS5Q9UPZ3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HPS5Q9UPZ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HPS5Q9UPZ3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HPS5Q9UPZ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
HPS5Q9UPZ3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
HPS5Q9UPZ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HPS5Q9UPZ3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
HPS5Q9UPZ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HPS5Q9UPZ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HPS5Q9UPZ3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HPS5Q9UPZ3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HPS5Q9UPZ3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HPS5Q9UPZ3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HPS5Q9UPZ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HPS5Q9UPZ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HPS5Q9UPZ3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HPS5Q9UPZ3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HPS5Q9UPZ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HPS5Q9UPZ3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HPS5Q9UPZ3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HPS5Q9UPZ3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HPS5Q9UPZ3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HPS5Q9UPZ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HPS5Q9UPZ3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HPS5Q9UPZ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HPS5Q9UPZ3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
HPS5Q9UPZ3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms