Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
INO80Q9ULG1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
INO80Q9ULG1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
INO80Q9ULG1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
INO80Q9ULG1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
INO80Q9ULG1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
INO80Q9ULG1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
INO80Q9ULG1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
INO80Q9ULG1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
INO80Q9ULG1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
INO80Q9ULG1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
INO80Q9ULG1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
INO80Q9ULG1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
INO80Q9ULG1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
INO80Q9ULG1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
INO80Q9ULG1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
INO80Q9ULG1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
INO80Q9ULG1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
INO80Q9ULG1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
INO80Q9ULG1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
INO80Q9ULG1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
INO80Q9ULG1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
INO80Q9ULG1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
INO80Q9ULG1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
INO80Q9ULG1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
INO80Q9ULG1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
INO80Q9ULG1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
INO80Q9ULG1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
INO80Q9ULG1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40■■■■□ 3.99
INO80Q9ULG1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
INO80Q9ULG1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
INO80Q9ULG1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
INO80Q9ULG1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
INO80Q9ULG1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
INO80Q9ULG1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
INO80Q9ULG1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
INO80Q9ULG1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
INO80Q9ULG1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
INO80Q9ULG1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
INO80Q9ULG1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
INO80Q9ULG1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
INO80Q9ULG1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
INO80Q9ULG1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
INO80Q9ULG1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
INO80Q9ULG1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
INO80Q9ULG1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
INO80Q9ULG1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
INO80Q9ULG1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
INO80Q9ULG1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
INO80Q9ULG1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
INO80Q9ULG1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
INO80Q9ULG1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
INO80Q9ULG1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
INO80Q9ULG1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
INO80Q9ULG1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
INO80Q9ULG1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
INO80Q9ULG1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
INO80Q9ULG1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
INO80Q9ULG1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
INO80Q9ULG1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
INO80Q9ULG1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
INO80Q9ULG1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
INO80Q9ULG1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
INO80Q9ULG1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
INO80Q9ULG1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
INO80Q9ULG1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
INO80Q9ULG1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
INO80Q9ULG1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
INO80Q9ULG1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
INO80Q9ULG1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
INO80Q9ULG1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
INO80Q9ULG1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
INO80Q9ULG1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
INO80Q9ULG1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
INO80Q9ULG1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
INO80Q9ULG1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
INO80Q9ULG1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
INO80Q9ULG1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
INO80Q9ULG1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
INO80Q9ULG1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
INO80Q9ULG1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
INO80Q9ULG1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
INO80Q9ULG1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
INO80Q9ULG1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
INO80Q9ULG1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
INO80Q9ULG1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
INO80Q9ULG1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
INO80Q9ULG1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
INO80Q9ULG1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
INO80Q9ULG1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
INO80Q9ULG1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
INO80Q9ULG1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
INO80Q9ULG1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
INO80Q9ULG1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
INO80Q9ULG1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
INO80Q9ULG1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
INO80Q9ULG1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
INO80Q9ULG1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC39.64■■■■□ 3.94
INO80Q9ULG1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
INO80Q9ULG1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms