Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP3Q9UKI2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDC42EP3Q9UKI2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDC42EP3Q9UKI2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP3Q9UKI2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP3Q9UKI2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDC42EP3Q9UKI2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP3Q9UKI2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP3Q9UKI2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP3Q9UKI2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDC42EP3Q9UKI2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDC42EP3Q9UKI2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP3Q9UKI2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC42EP3Q9UKI2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP3Q9UKI2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP3Q9UKI2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP3Q9UKI2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC42EP3Q9UKI2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP3Q9UKI2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP3Q9UKI2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP3Q9UKI2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP3Q9UKI2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP3Q9UKI2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP3Q9UKI2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP3Q9UKI2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP3Q9UKI2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP3Q9UKI2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP3Q9UKI2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP3Q9UKI2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP3Q9UKI2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP3Q9UKI2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDC42EP3Q9UKI2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms