Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK17

KCND3, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND3Q9UK17 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCND3Q9UK17 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCND3Q9UK17 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCND3Q9UK17 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCND3Q9UK17 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCND3Q9UK17 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCND3Q9UK17 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCND3Q9UK17 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCND3Q9UK17 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCND3Q9UK17 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCND3Q9UK17 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCND3Q9UK17 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCND3Q9UK17 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCND3Q9UK17 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCND3Q9UK17 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCND3Q9UK17 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCND3Q9UK17 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCND3Q9UK17 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCND3Q9UK17 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCND3Q9UK17 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCND3Q9UK17 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCND3Q9UK17 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCND3Q9UK17 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCND3Q9UK17 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCND3Q9UK17 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCND3Q9UK17 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCND3Q9UK17 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCND3Q9UK17 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCND3Q9UK17 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCND3Q9UK17 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCND3Q9UK17 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCND3Q9UK17 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCND3Q9UK17 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCND3Q9UK17 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCND3Q9UK17 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KCND3Q9UK17 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCND3Q9UK17 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCND3Q9UK17 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCND3Q9UK17 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCND3Q9UK17 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCND3Q9UK17 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCND3Q9UK17 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCND3Q9UK17 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCND3Q9UK17 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCND3Q9UK17 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCND3Q9UK17 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCND3Q9UK17 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCND3Q9UK17 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCND3Q9UK17 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCND3Q9UK17 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCND3Q9UK17 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCND3Q9UK17 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCND3Q9UK17 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KCND3Q9UK17 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCND3Q9UK17 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KCND3Q9UK17 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCND3Q9UK17 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCND3Q9UK17 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCND3Q9UK17 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KCND3Q9UK17 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCND3Q9UK17 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCND3Q9UK17 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCND3Q9UK17 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCND3Q9UK17 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCND3Q9UK17 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCND3Q9UK17 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCND3Q9UK17 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCND3Q9UK17 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KCND3Q9UK17 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCND3Q9UK17 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms