Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TSKSQ9UJT2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TSKSQ9UJT2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TSKSQ9UJT2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TSKSQ9UJT2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TSKSQ9UJT2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TSKSQ9UJT2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
TSKSQ9UJT2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TSKSQ9UJT2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TSKSQ9UJT2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TSKSQ9UJT2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TSKSQ9UJT2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TSKSQ9UJT2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TSKSQ9UJT2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TSKSQ9UJT2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TSKSQ9UJT2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TSKSQ9UJT2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TSKSQ9UJT2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TSKSQ9UJT2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TSKSQ9UJT2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
TSKSQ9UJT2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TSKSQ9UJT2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TSKSQ9UJT2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TSKSQ9UJT2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TSKSQ9UJT2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TSKSQ9UJT2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TSKSQ9UJT2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TSKSQ9UJT2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TSKSQ9UJT2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
TSKSQ9UJT2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TSKSQ9UJT2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TSKSQ9UJT2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TSKSQ9UJT2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TSKSQ9UJT2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TSKSQ9UJT2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TSKSQ9UJT2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TSKSQ9UJT2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TSKSQ9UJT2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TSKSQ9UJT2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TSKSQ9UJT2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TSKSQ9UJT2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TSKSQ9UJT2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TSKSQ9UJT2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
TSKSQ9UJT2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TSKSQ9UJT2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TSKSQ9UJT2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TSKSQ9UJT2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TSKSQ9UJT2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TSKSQ9UJT2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TSKSQ9UJT2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TSKSQ9UJT2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TSKSQ9UJT2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TSKSQ9UJT2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TSKSQ9UJT2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TSKSQ9UJT2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TSKSQ9UJT2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TSKSQ9UJT2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TSKSQ9UJT2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TSKSQ9UJT2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TSKSQ9UJT2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TSKSQ9UJT2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TSKSQ9UJT2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TSKSQ9UJT2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TSKSQ9UJT2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TSKSQ9UJT2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TSKSQ9UJT2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TSKSQ9UJT2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TSKSQ9UJT2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TSKSQ9UJT2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TSKSQ9UJT2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TSKSQ9UJT2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TSKSQ9UJT2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TSKSQ9UJT2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TSKSQ9UJT2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TSKSQ9UJT2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TSKSQ9UJT2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TSKSQ9UJT2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
TSKSQ9UJT2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TSKSQ9UJT2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
TSKSQ9UJT2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TSKSQ9UJT2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TSKSQ9UJT2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TSKSQ9UJT2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TSKSQ9UJT2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
TSKSQ9UJT2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
TSKSQ9UJT2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TSKSQ9UJT2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TSKSQ9UJT2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TSKSQ9UJT2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TSKSQ9UJT2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TSKSQ9UJT2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TSKSQ9UJT2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TSKSQ9UJT2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TSKSQ9UJT2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TSKSQ9UJT2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TSKSQ9UJT2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TSKSQ9UJT2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TSKSQ9UJT2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TSKSQ9UJT2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
TSKSQ9UJT2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms