Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPN4Q9UHM6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPN4Q9UHM6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPN4Q9UHM6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPN4Q9UHM6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OPN4Q9UHM6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
OPN4Q9UHM6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN4Q9UHM6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN4Q9UHM6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN4Q9UHM6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPN4Q9UHM6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPN4Q9UHM6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPN4Q9UHM6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPN4Q9UHM6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPN4Q9UHM6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPN4Q9UHM6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
OPN4Q9UHM6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
OPN4Q9UHM6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPN4Q9UHM6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPN4Q9UHM6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPN4Q9UHM6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPN4Q9UHM6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPN4Q9UHM6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPN4Q9UHM6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPN4Q9UHM6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OPN4Q9UHM6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPN4Q9UHM6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OPN4Q9UHM6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPN4Q9UHM6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OPN4Q9UHM6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms