Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SRP68Q9UHB9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SRP68Q9UHB9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SRP68Q9UHB9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SRP68Q9UHB9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SRP68Q9UHB9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SRP68Q9UHB9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SRP68Q9UHB9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SRP68Q9UHB9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SRP68Q9UHB9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
SRP68Q9UHB9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
SRP68Q9UHB9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SRP68Q9UHB9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SRP68Q9UHB9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SRP68Q9UHB9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SRP68Q9UHB9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SRP68Q9UHB9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SRP68Q9UHB9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SRP68Q9UHB9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SRP68Q9UHB9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SRP68Q9UHB9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SRP68Q9UHB9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SRP68Q9UHB9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SRP68Q9UHB9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SRP68Q9UHB9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SRP68Q9UHB9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SRP68Q9UHB9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SRP68Q9UHB9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SRP68Q9UHB9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SRP68Q9UHB9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SRP68Q9UHB9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SRP68Q9UHB9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SRP68Q9UHB9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SRP68Q9UHB9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SRP68Q9UHB9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SRP68Q9UHB9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SRP68Q9UHB9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SRP68Q9UHB9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SRP68Q9UHB9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SRP68Q9UHB9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SRP68Q9UHB9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SRP68Q9UHB9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SRP68Q9UHB9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SRP68Q9UHB9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SRP68Q9UHB9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SRP68Q9UHB9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SRP68Q9UHB9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SRP68Q9UHB9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SRP68Q9UHB9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SRP68Q9UHB9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SRP68Q9UHB9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SRP68Q9UHB9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SRP68Q9UHB9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SRP68Q9UHB9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SRP68Q9UHB9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SRP68Q9UHB9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SRP68Q9UHB9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SRP68Q9UHB9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SRP68Q9UHB9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SRP68Q9UHB9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SRP68Q9UHB9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SRP68Q9UHB9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SRP68Q9UHB9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SRP68Q9UHB9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
SRP68Q9UHB9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SRP68Q9UHB9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SRP68Q9UHB9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SRP68Q9UHB9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SRP68Q9UHB9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SRP68Q9UHB9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SRP68Q9UHB9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SRP68Q9UHB9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SRP68Q9UHB9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SRP68Q9UHB9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SRP68Q9UHB9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SRP68Q9UHB9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SRP68Q9UHB9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SRP68Q9UHB9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SRP68Q9UHB9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SRP68Q9UHB9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SRP68Q9UHB9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SRP68Q9UHB9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SRP68Q9UHB9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SRP68Q9UHB9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SRP68Q9UHB9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
SRP68Q9UHB9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SRP68Q9UHB9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SRP68Q9UHB9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SRP68Q9UHB9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SRP68Q9UHB9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SRP68Q9UHB9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SRP68Q9UHB9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SRP68Q9UHB9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SRP68Q9UHB9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SRP68Q9UHB9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SRP68Q9UHB9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SRP68Q9UHB9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SRP68Q9UHB9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SRP68Q9UHB9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SRP68Q9UHB9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms