Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2I0

CPSF2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF2Q9P2I0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF2Q9P2I0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF2Q9P2I0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CPSF2Q9P2I0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPSF2Q9P2I0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CPSF2Q9P2I0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF2Q9P2I0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF2Q9P2I0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF2Q9P2I0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CPSF2Q9P2I0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CPSF2Q9P2I0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPSF2Q9P2I0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPSF2Q9P2I0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CPSF2Q9P2I0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPSF2Q9P2I0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CPSF2Q9P2I0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPSF2Q9P2I0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CPSF2Q9P2I0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPSF2Q9P2I0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF2Q9P2I0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF2Q9P2I0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPSF2Q9P2I0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF2Q9P2I0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF2Q9P2I0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPSF2Q9P2I0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF2Q9P2I0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF2Q9P2I0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF2Q9P2I0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPSF2Q9P2I0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPSF2Q9P2I0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPSF2Q9P2I0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPSF2Q9P2I0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPSF2Q9P2I0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPSF2Q9P2I0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPSF2Q9P2I0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPSF2Q9P2I0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms