Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PODXL2Q9NZ53 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PODXL2Q9NZ53 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PODXL2Q9NZ53 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PODXL2Q9NZ53 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PODXL2Q9NZ53 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PODXL2Q9NZ53 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PODXL2Q9NZ53 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PODXL2Q9NZ53 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PODXL2Q9NZ53 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PODXL2Q9NZ53 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PODXL2Q9NZ53 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PODXL2Q9NZ53 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PODXL2Q9NZ53 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PODXL2Q9NZ53 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PODXL2Q9NZ53 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PODXL2Q9NZ53 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PODXL2Q9NZ53 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PODXL2Q9NZ53 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PODXL2Q9NZ53 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PODXL2Q9NZ53 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PODXL2Q9NZ53 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PODXL2Q9NZ53 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PODXL2Q9NZ53 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PODXL2Q9NZ53 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PODXL2Q9NZ53 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PODXL2Q9NZ53 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PODXL2Q9NZ53 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PODXL2Q9NZ53 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PODXL2Q9NZ53 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PODXL2Q9NZ53 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PODXL2Q9NZ53 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PODXL2Q9NZ53 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
PODXL2Q9NZ53 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PODXL2Q9NZ53 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PODXL2Q9NZ53 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PODXL2Q9NZ53 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PODXL2Q9NZ53 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PODXL2Q9NZ53 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PODXL2Q9NZ53 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PODXL2Q9NZ53 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PODXL2Q9NZ53 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PODXL2Q9NZ53 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PODXL2Q9NZ53 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PODXL2Q9NZ53 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PODXL2Q9NZ53 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PODXL2Q9NZ53 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PODXL2Q9NZ53 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PODXL2Q9NZ53 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PODXL2Q9NZ53 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PODXL2Q9NZ53 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PODXL2Q9NZ53 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PODXL2Q9NZ53 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PODXL2Q9NZ53 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PODXL2Q9NZ53 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PODXL2Q9NZ53 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PODXL2Q9NZ53 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PODXL2Q9NZ53 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PODXL2Q9NZ53 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PODXL2Q9NZ53 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PODXL2Q9NZ53 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PODXL2Q9NZ53 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PODXL2Q9NZ53 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PODXL2Q9NZ53 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PODXL2Q9NZ53 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PODXL2Q9NZ53 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PODXL2Q9NZ53 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PODXL2Q9NZ53 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PODXL2Q9NZ53 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
PODXL2Q9NZ53 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PODXL2Q9NZ53 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PODXL2Q9NZ53 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PODXL2Q9NZ53 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PODXL2Q9NZ53 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PODXL2Q9NZ53 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PODXL2Q9NZ53 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
PODXL2Q9NZ53 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
PODXL2Q9NZ53 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PODXL2Q9NZ53 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PODXL2Q9NZ53 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PODXL2Q9NZ53 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PODXL2Q9NZ53 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PODXL2Q9NZ53 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PODXL2Q9NZ53 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PODXL2Q9NZ53 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PODXL2Q9NZ53 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PODXL2Q9NZ53 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PODXL2Q9NZ53 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PODXL2Q9NZ53 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PODXL2Q9NZ53 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PODXL2Q9NZ53 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PODXL2Q9NZ53 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PODXL2Q9NZ53 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PODXL2Q9NZ53 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PODXL2Q9NZ53 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PODXL2Q9NZ53 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PODXL2Q9NZ53 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PODXL2Q9NZ53 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PODXL2Q9NZ53 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PODXL2Q9NZ53 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms