Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK1

TLR7, Toll-like receptor 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR7Q9NYK1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
TLR7Q9NYK1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TLR7Q9NYK1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
TLR7Q9NYK1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TLR7Q9NYK1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TLR7Q9NYK1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TLR7Q9NYK1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TLR7Q9NYK1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TLR7Q9NYK1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TLR7Q9NYK1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TLR7Q9NYK1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TLR7Q9NYK1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TLR7Q9NYK1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TLR7Q9NYK1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TLR7Q9NYK1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TLR7Q9NYK1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TLR7Q9NYK1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
TLR7Q9NYK1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TLR7Q9NYK1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TLR7Q9NYK1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TLR7Q9NYK1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TLR7Q9NYK1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TLR7Q9NYK1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TLR7Q9NYK1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
TLR7Q9NYK1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TLR7Q9NYK1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TLR7Q9NYK1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
TLR7Q9NYK1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TLR7Q9NYK1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TLR7Q9NYK1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
TLR7Q9NYK1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TLR7Q9NYK1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TLR7Q9NYK1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TLR7Q9NYK1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TLR7Q9NYK1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
TLR7Q9NYK1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TLR7Q9NYK1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TLR7Q9NYK1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TLR7Q9NYK1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TLR7Q9NYK1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TLR7Q9NYK1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TLR7Q9NYK1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TLR7Q9NYK1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TLR7Q9NYK1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TLR7Q9NYK1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TLR7Q9NYK1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TLR7Q9NYK1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TLR7Q9NYK1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TLR7Q9NYK1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TLR7Q9NYK1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TLR7Q9NYK1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TLR7Q9NYK1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TLR7Q9NYK1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TLR7Q9NYK1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TLR7Q9NYK1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TLR7Q9NYK1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TLR7Q9NYK1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TLR7Q9NYK1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TLR7Q9NYK1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
TLR7Q9NYK1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TLR7Q9NYK1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TLR7Q9NYK1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TLR7Q9NYK1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TLR7Q9NYK1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TLR7Q9NYK1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TLR7Q9NYK1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
TLR7Q9NYK1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TLR7Q9NYK1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
TLR7Q9NYK1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TLR7Q9NYK1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TLR7Q9NYK1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TLR7Q9NYK1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TLR7Q9NYK1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TLR7Q9NYK1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TLR7Q9NYK1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TLR7Q9NYK1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TLR7Q9NYK1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TLR7Q9NYK1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TLR7Q9NYK1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms