Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHCHD3Q9NX63 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHCHD3Q9NX63 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHCHD3Q9NX63 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHCHD3Q9NX63 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHCHD3Q9NX63 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHCHD3Q9NX63 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHCHD3Q9NX63 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHCHD3Q9NX63 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHCHD3Q9NX63 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHCHD3Q9NX63 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHCHD3Q9NX63 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHCHD3Q9NX63 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHCHD3Q9NX63 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHCHD3Q9NX63 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHCHD3Q9NX63 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHCHD3Q9NX63 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHCHD3Q9NX63 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHCHD3Q9NX63 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHCHD3Q9NX63 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHCHD3Q9NX63 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHCHD3Q9NX63 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHCHD3Q9NX63 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHCHD3Q9NX63 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHCHD3Q9NX63 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHCHD3Q9NX63 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHCHD3Q9NX63 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHCHD3Q9NX63 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHCHD3Q9NX63 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHCHD3Q9NX63 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHCHD3Q9NX63 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHCHD3Q9NX63 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHCHD3Q9NX63 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHCHD3Q9NX63 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHCHD3Q9NX63 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHCHD3Q9NX63 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHCHD3Q9NX63 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHCHD3Q9NX63 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHCHD3Q9NX63 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHCHD3Q9NX63 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHCHD3Q9NX63 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHCHD3Q9NX63 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHCHD3Q9NX63 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHCHD3Q9NX63 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHCHD3Q9NX63 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHCHD3Q9NX63 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHCHD3Q9NX63 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHCHD3Q9NX63 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHCHD3Q9NX63 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHCHD3Q9NX63 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHCHD3Q9NX63 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms